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如何建立r语言脚本

发布时间: 2022-12-07 13:35:44

1. Web页面如何调用R语言脚本

最简单的方法就是每次引用时把写好的函数复制一下,到R console 中,然后写其他的。然后,编好的函数写成.r 文件,下次直接使用命令 source(function.r)就能导入使用了。

2. r语言生成html文件怎么演示

1、首先根据已有函数自定义函数,并制作表格。定义一个函数,输入数据集的变量并得到该变量的统计结果。
2、其次函数定义完成后,建立一个空的列表,以储存每个变量的分析结果,并进行分析,将结果储存在列表中。
3、然后将所有结果merge到一个矩阵中,并建立rgroup(table1第一列的变量名) 和 n.rgroup(table 1第一列每个变量的行数)。
4、最后就一键生成html表格了。

3. 基于R语言的数据标准化处理脚本

基于R语言的数据标准化处理脚本
数据标准化(Normalization)
将数据按比例缩放,使之落入一个小的特定区间。去除数据的单位限制,将其转化为无量纲的纯数值,便于不同单位或量级的指标能够进行比较和加权。
数据标准化处理主要包括数据同趋化处理和无量纲化处理两个方面。
数据同趋化处理主要解决不同性质数据问题,对不同性质指标直接加总不能正确反映不同作用力的综合结果,须先考虑改变逆指标数据性质,使所有指标对测评方案的作用力同趋化,再加总才能得出正确结果。
数据无量纲化处理主要解决数据的可比性。数据标准化的方法有很多种,常用的有“最小—最大标准化”、“Z-score标准化”和“按小数定标标准化”等。经过上述标准化处理,原始数据均转换为无量纲化指标测评值,即各指标值都处于同一个数量级别上,可以进行综合测评分析。
min-max标准化(Min-max normalization)
也叫离差标准化,是对原始数据的线性变换,使结果落在[0,1]区间,转换函数如下:
正向指标:(x-min)/(max-min)
负向指标:(max-x)/(max-min)
其中max为样本数据的最大值,min为样本数据的最小值。这种方法有一个缺陷就是当有新数据加入时,可能导致max和min的变化,需要重新定义。
R语言实现
# 标准化处理
min.max.norm <- function(x){
((x-min(x))/(max(x)-min(x)))
} #正向指标

max.min.norm <- function(x){
((max(x)-x)/(max(x)-min(x)))
} #负向指标

data_1 <- apply(data[,-c(3,4)],2,min.max.norm) #正向指标处理
data_2 <- apply(data[,c(3,4)],2,max.min.norm) #负向指标处理
#注意array只能用在二维及以上

data_t <- cbind(data_1,data_2)

4. R语言作业辅导老师有吗

R语言作业作业涉及的问题如下:

1、R和RStudio,以及模型问题的生物学背景和课程中使用的特定机器学习方法。

2、R编程模型,以及如何在实践中使用R语言编写脚本。

3、如何使用R和Shiny构建交互式图形应用程序,如何使用R开发复杂的关系数据。

4、如何在R中导入和处理数据(数据清理和整理)。

5、如何使用集群计算(使用Apache Spark)运行交互式工作流。

6、数据可视化和结果绘图(例如使用ggplot2),以及如何在特定生物学问题的背景下解释分析结果。

5. r语言编程的步骤

r语言编程的步骤?R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。
工具原料一台电脑下载完毕的R software
方法/步骤分步阅读
1
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安装完毕R语言,新建属于自己的R变成文件夹,然后 File ->Change Dir..,设置成自己的工作文件,自己工作空间将都会产生在这个文件夹下。
2
/5
然后Files - > New Script,打开新的脚本编辑,在这里键入自己代码,编辑。
在此模式下,摁F5键意味着执行这一行,当我们编辑很多行的时候,我们可以进行全选,然后摁下F5,这样就会执行所有行的代码。
3
/5
下面进行实战,我们下面将会用R语言画出一个简单房子,具体的代码含义不解释,推荐Manning出版的《R语言实战》,里面有大量的联系及讲解。
4
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选中,然后执行F5按键,R语言就会画出一个简单的房子,具体代码可以参见下图。
5
/5
总之,R语言是一个非常好的统计软件,在生物统计,金融统计中发挥着越来越多的作用,同时R语言作为一款开源软件,也被世界的R语言兴趣者优化着。
注意事项
R作为一款免费的软件,有时候即使编正确的情况下,仍然可能出现错误
软件的学习在于多联系
内容仅供参考并受版权保护

6. R语言细节汇总

开始一个新的R语言数据分析新项目,管理脚本、图片、文件的推荐方式:打开Rstudio,新建Rproject,新建脚本(脚本存放在生成的Rproject文件夹中)。

若要逆着优先顺序操作,将返回NA

x %in%y是判断x中的每一个元素是否在y中存在。
若x和y长度不一致,返回x个TRUE或者FALSE。

⚠️练习:按如下方式生成test数据框,提取test中,最后一列值为a或c的行,组成一个新的数据框,赋值给test2。

这里如果使用==来判断,就相当于拿test$n的15个值与c('a','c')的2个值来一一对应着比对,因为两者长度不同,会发生循环补齐,其效果如下图,明显不是我们想要的结果。

x%in%y:选出x是y中一个值时的所有行

另:取交集、差集、并集的函数为:intersect(x,y)、union(x,y)、setdiff(x,y)、setdiff(y,x)

match函数的用法参考: https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/84927296

使用match函数修改矩阵的信息

方法1--设置CRAN镜像:打开R studio,点击tools--global option--packages,选择Package CRAN reposotory。
方法2--设置CRAN和bioconctor镜像

用于读取/导出文件的R包

rio可以不用区分读入文件类型,大部分文件可直接用import()读取。

@ 是R中,S4类的一个操作符, 用于提取S4对象中的内容(slot) ,比如:

这个时候$是不起作用的,因为被S4类重写了。可以自己定义$的行为。
⚠️: matrix不能直接用$取列

⚠️因此如果想取数据框中的部分行,在方括号中直接输入行数即可,返回的仍然是数据框。但如果加了逗号,会丧失数据框的格式,也就是会使数据框的行名(往往是基因名)丢失。

后面存图时可以用paste0连接GSE编号和图片类型及后缀,这样不同数据的分析得到的图片名就跟数据相一致。

通过将变量因子化来设置柱条的顺序

7. r语言如何运行脚本

rstudio可以运行脚本,脚本文件格式一般为rscript,打开脚本,选择程序,点击run按钮即可运行。

8. python如何调用执行R语言脚本

要用rpy2包的数据包,python才能调用R语言。