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ftp怎么下载本地blast

发布时间: 2022-09-13 03:53:08

① 两台电脑怎么通过ftp下载文件

在两台计算机之间传输数据吧,如果只是传数据,使用共享文件夹就可以!
方法如下:1。在我的电脑D盘,建立一个文件夹D:/share2。在share文件夹上点右键,选择共享,找到“网络共享和安全”,勾选“在网络上共享这个文件夹”项3。查看下本机的IP(如:192.168.1.23)或是计算机名(pc1),4。在另一台计算机上,当然得保证在同一网段,打开我的电脑,在地址栏输入开启共享机的IP地地址如:\\192.168.1.23,如果共享成功,就可以看到share文件夹,就可以相互传文件了

另外如果使用FTP的话,其实不能叫传文件,这个方法实际是建立一个FTP服务器,然后让客户机去访问FTP服务器,从FTP上下载文件到本地计算机,当然这个的目的,也是为了实现文件交换。方法如下:1。上网下载FTP服务器软件,如cuteFTP或是HomeFTP(推荐,主要是配置简单易用),或是直接在操作系统上安装IIS服务器(这个只能是windows系统)然后应用IIS的FTP功能也可以实现FTP,当然也可以用其它的FTP服务器;这里以HOMEFTPServer为例讲解2。安装下载好的HOMEFTP服务器,安装好之后进行配置
1点击设置,可以配置匿名用户,指定目录,即FTP文件服务器目录(如:D:\FTPRoot),也可以配置虚拟目录,配置后可以将其它盘(F:\share)的目录虚拟到FTPRoot下,而可以获得FTPRoot的权限;这个服务器就这点最精典
2点击新增成员,可以添加新用户,即非匿名用户,可以配置权限和虚拟目录;
3配置好之后点击开始服务启动FTP服务器
4查看服务器(装有FTP软件的计算机)的IP地址如:192.168.1.233。在客户机,打开我的电脑,在地址栏输入ftp://192.168.1.23如果配置成功,即可以访问FTP服务器,如果开启文件上传权限,可以上传或下载文件
当然也可以下载一个FTP服务器客户端工具,即可以访问
注意:如果没安装FTP客户端,使用非匿名用户访问时要用到帐号和密码,格式为:ftp://用户:密码@服务器IP如:ftp://admin:[email protected]登陆后,获得admin用户的所有权限

② ftp中的文件怎么下载

用浏览器,打开FTP服务器后,登录,只要当前的帐号有列表和下载的权限,就能看到文件,在文件上直接拖放到本地,即可下载。

或者在文件上右键,选择目标另存为,也可以下载并保存到当前电脑中。

③ 如何使BLAST程序在windows计算机上本地化

Blast本地化详细攻略(基于Windows系统)by Fredy 2010-12-16 17:40 | (分类:默认分
类)
最近终于把Blast本地化弄明白了,参照网上的攻略稍微整理了一下,希望能给学生物的朋友带来一些方便,毕竟好的生物信息学分析是成功的一半嘛~~ 1. 从NCBI上下载Blast本地化程序,下载地址:
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/release/2.2.9/blast-2.2.9-ia32-win32.exe 安装得到的Blast本地化软件安装包,安装路径例如"C:\Blast\bin\"。
2. 从相关生物信息学网站上下载数据库,如NCBI的nt库,DFCI的相关EST数据库或者是用户自己建立的fasta格式的核酸序列文件等,将数据库文件移动至Blast本地化程序目录“C:\Blast\bin”
3. 用文本编辑器(txt文件改名字及后缀)创建一个ncbi.ini文件,文件包含下面内容: [NCBI]Data="C:\blast\data\"
将ncbi.ini文件存放到系统的Windows 或者 WINNT目录。
4. 将Blast本地化程序目录添加路径中(该步骤非必须,但会给以后的操作带来方便),方法:
a)右击我的电脑选择属性,选择高级,点击环境变量,设置环境变量
b)系统变量中,选择Path,点击“编辑”,在变量值的后面添加Blast本地化程序所在路径,如“C:\Blast\bin”,点击确定,将安装路径添加到path。
5. 测试,打开dos窗口(点击开始,选择运行,打开的输入框中输入"cmd”,确定),键入"blastall”,回车,如果安装正确,将显示blastall的所有参数说明。如果之前没有进行步骤4,则访问Blast本地化程序所在文件夹后输入"blastall"进行测试。
【访问文件夹时可能用到dos命令有盘符切换"X:"及路径切换"cd \blast\bin”】
6. 下载得到的数据库为fasta格式,需要经过格式转化后才能进行blast,打开dos窗口,访问Blast本地化程序所在文件夹,输入格式化数据库命令: formatdb.exe -i nt.fas -p F -o F
命令中nt.fasta可换为其他预进行格式化的原始fasta数据库文件,稍等片刻,电脑完成数据库的格式化,会在在原数据库文件所在文件夹生成一系列文件,格式化过程无系统报错,Blast本地化体系即构建完成。
7. Blast本地化:在Blast本地化程序所在文件夹创建test.txt文件,将需要Blast的序列以fasta格式存于该文件中,打开dos窗口,访问Blast本地化程序所在文件夹,输入Blastn命令:
blastall -p blastn -d nt.fas -i test.txt -o out.txt

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稍等片刻,Blast结果即存于系统自动生成的out.txt文件中。
此外就是建议将常用命令保存在一个txt文件中,需要时直接在dos里面用鼠标右键粘贴就ok了。在test.txt中以fasta格式存储多个序列可以一次得到比对多个序列的结果。

④ 怎么利用ftp把资料下载到本地电脑

请确认你在访问那个FTP时是不是有读取权限。也就是下载权限。如果没有权限就会出现你说的那种情况。
如果有权限的话直接用鼠标选中你要下载的文件或目录右键单击,选中复制,然后选择你要存放的路径,点确定即可,当然,也可以用楼上说的方法,找个FTP客户端FLASHFTP,也可以用迅雷的FTP资源探测器。选择新建,把FTP信息填写一下就可以了。~~

⑤ 怎么从从ncbi的ftp上下了windows的本地blast

可以四个一起。网页上有说明“owertextbox..,.Reformattheresultsandcheck'CDSfeature'todisplaythatannotation.”也就是说在上下的输入位置,可以同时输入一个以上的序列。如果上下同时输入2个,就是4个序列了。

⑥ 怎么从FTP上下载东西

其实我建议使用一个专门的ftp客户端来使用ftp比较好,这样你只需要在客户端上输入ftp服务器的IP和端口,账号,密码,就能轻松的上传和下载文件,非常实用。

这里我推荐使用IIS7服务器管理工具,它可以作为FTP的客户端,想要进行FTP的上传下载操作,只需要下载安装iis7服务器管理工具就可以了!免费下载,很方便。

同时它还可以作为VNC的客户端,进行VNC的相应操作!它能够连接Windows和Linux系统下的服务器和VPS,能满足你不同系统的使用,感觉不错的话可以试试

⑦ 如何使用get命令利用FTP下载文件到本地

1、从远程ftp服务器下载文件的命令格式:
get 远程ftp服务器上当前目录下要下载的文件名。
2、附上ftp常用命令,如下所示:
FTP>open [ftpservername],和指定的远程Linux FTP服务器连接。
FTP>user [username] [password],使用指定远程Linux FTP服务器的用户登录。
FTP>pwd,显示远程Linux FTP服务器上的当前路径。
FTP>ls,列出远程Linux FTP服务器上当前路径下的目录和文件。
FTP>dir,列出远程Linux FTP服务器上当前路径下的目录和文件(同上)。
FTP>mkdir [foldname],在远程Linux FTP服务器上当前路径下建立指定目录。
FTP>rmdir [foldname],删除远程Linux FTP服务器上当前路径下的指定目录。
FTP>cd [foldname],更改远程Linux FTP服务器上的工作目录。
FTP>delete [filename],删除远程Linux FTP服务器上指定的文件。
FTP>rename [filename] [newfilename],重命名远程Linux FTP服务器上指定的文件。
FTP>close,从远程Linux FTP服务器断开但保留FTP命令参数提示。
FTP>disconnect,从远程Linux FTP服务器断开但保留FTP命令参数提示(同上)。
FTP>bye,结束和远程Linux FTP服务器的连接。
FTP>quit,结束和远程Linux FTP服务器的连接(同上)。
FTP>!,直接从远程Linux FTP服务器进入到本地shell中。
FTP>exit,(接上步)从本地shell环境中返回到远程Linux FTP服务器环境下。
FTP>!ls,列出本地机器上当前路径下的目录和文件。
FTP>lcd [foldname],更改本地机器的工作目录。

⑧ 怎么从从ncbi的ftp上下了windows的本地blast

This document describes the "BLAST" databases available on the NCBI
FTP site under the /blast/db directory. The direct URL is:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db 本地BLAST数据库下载地址

⑨ 怎么从从ncbi的ftp上下了windows的本地blast

This document describes the "BLAST" databases available on the NCBI
FTP site under the /blast/db directory. The direct URL is:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db 本地BLAST数据库下载地址
1. General Introction
NCBI BLAST home pages (http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/) use a standard
set of BLAST databases for Nucleotide, Protein, and Translated BLAST
searches. These databases are made available in the /blast/db directory as
compressed archives (ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/) in pre-formatted
format.这些数据库是已经预先进行过makeblastdb命令的,下载后可以直接使用
The FASTA databases reside under the /blast/db/FASTA directory.
The pre-formatted databases offer the following advantages:
* The pre-formatted databases are smaller in size and therefore are
faster to download;
* Sequences in FASTA format can be generated from the pre-formatted
databases by the fastacmd utility; 可以从这些数据库文件中导出FASTA文件
* A convenient script (update_blastdb.pl) is available to download
the pre-formatted databases from the NCBI ftp site; 可用该脚本升级数据库
* Pre-formatting removes the need to run formatdb; 无需再运行建库命令行
* Taxonomy ids are available for each database entry.
Pre-formatted databases must be downloaded using the update_blastdb.pl
script or via FTP in binary mode. Documentation for the update_blastdb.pl
script can be obtained by running the script without any arguments (perl is
required). 下载数据库时,需要用到perl脚本update_blastdb.pl,或使用FTP下载工具
The compressed files downloaded must be inflated with gzip or other decompress
tools. The BLAST database files can then be extracted out of the resulting
tar file using tar program on Unix/Linux or WinZip and StuffIt Expander
on Windows and Macintosh platforms, respectively.下载的数据库为压缩包,要解压缩
Large databases are formatted in multiple 1 Gigabytes volumes, which
are named using the database.##.tar.gz convention. All relevant volumes
are required. An alias file is provided so that the database can be called
using the alias name without the extension (.nal or .pal). For example,
to call est database, simply use "-d est" option in the commandline
(without the quotes). 大的数据库通常分为多个压缩包,例如nr库有11个压缩包。所有的相关压缩包
都要下载,解压。解压缩会生成对应的库文件,同时生成一个nr.pal文件。检索nr库时输入-d nr 即可。
Certain databases are subsets of a larger parental database. For those
databases, alias and mask files, rather than actual databases, are provided.
The mask file needs the parent database to function properly. The parent
databases should be generated on the same day as the mask file. For
example, to use swissprot pre-formatted database, swissprot.tar.gz, one
will need to get the nr.tar.gz with the same date stamp. 有些数据库是大数据库
的子集,使用这些子集数据库时,必须同时下载其(相同日期的)大数据库
Additional BLAST databases that are not provided in pre-formatted
formats are available in the FASTA subdirectory. 有些BLAST数据库没有提供预先建库
的文件,这些数据库可以从FASTA文件夹里下载 For genomic BLAST
databases, please check the genomes ftp directory at:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/ 在这里下载基因组BLAST数据库

2. Contents of the /blast/db/ directory
The pre-formatted BLAST databases are archived in this directory. The
name of these databases and their contents are listed below.
数据库名称 数据库内容
+----------------------+-----------------------------------------------+
|File Name | Content Description |
+----------------------+-----------------------------------------------+
/FASTA | subdirectory for FASTA formatted sequences
存放FASTA格式序列的子文件夹

README | README for this subdirectory (this file)
env_nr.*tar.gz | Environmental protein sequences 环境蛋白序列
env_nt.*tar.gz | Environmental nucleotide sequences 环境核苷酸序列
est.*tar.gz | volumes of the formatted est database
| from the EST division of GenBank, EMBL,
| and DDBJ. EST数据库