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基因组学数据库

发布时间: 2022-05-12 15:22:12

㈠ 康黎医学是否有针对中国人群的抑郁症用药基因数据库

有的,康黎医学自建针对中国人群的抑郁症用药基因数据库,研发的药物基因组学项目对临床用药方案的指导具有重大意义。通过基因检测,可整体评估患者药物基因情况,包括药物代谢、毒性、应答等,给予临床医生真实的基因数据和可靠的用药选择,从而达到精准治疗的目的。
在2019年4月的第十五届精神科医师年会上,湖北省人民医院主任医师刘忠纯教授在主题为“精准医疗在精神疾病领域的应用”的演讲,演讲中特意强调了康黎医学建立的针对中国人群的精神疾病用药相关基因变异位点临床数据库,为精神疾病临床提供精确的遗传数据、专业分析方案,并展望了开展基于中国人群的临床应用研究及基于AI的治疗策略。从刘教授的肯定可以看出康黎医学自建针对中国人的抑郁症用药基因数据库对于中国抑郁症治疗发展的重要性。

㈡ 基因组数据库的GDB数据库

由美国Johns Hopkins大学于1990年建立的GDB是重要的人类基因组数据库,由加拿大儿童医院生物信息中心负责管理。
GDB数据库用表格方式给出基因组结构数据,包括基因单位、PCR位点、细胞遗传标记、EST、叠连群(Contig)、重复片段等;并可显示基因组图谱,其中包括细胞遗传图、连锁图、放射杂交图、叠连群图、转录图等;并给出等位基因等基因多态性数据库。此外,GDB数据库还包括了与核酸序列数据库GenBank和EMBL、遗传疾病数据库OMIM、文献摘要数据库MedLine等其它网络信息资源的超文本链接。
GDB数据库是用大型商业软件Sybase数据库管理系统开发的,并用Java语言编写基因图谱显示程序,为用户提供了很好的界面,缺点是传输速度受到一定限制。
GDB数据库是国际合作的成果,其宗旨是为从事基因组研究的生物学家和医护人员提供人类基因组信息资源。其数据来自于世界各国基因组研究的成果,经过注册的用户可以直接向GDB数据库中添加和编辑数据。

㈢ 基因组学与应用生物学是核心期刊吗

《基因组学与应用生物学》是中国四大期刊数据库之核心期刊:
中国科技期刊全文数据库(清华大学知网数据库)
《中文核心期刊要目总览》核心期刊(北京大学图书馆,2011年版,即第六版)
中国科学引文数据库(CSCD)来源期刊(中国科学院文献情报中心)
中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊,中国科学技术信息研究所)

㈣ 核酸序列数据库和基因组数据库的区别

核酸序列数据库(genbank)和基因组数据库(ensemble)的区别:
1、GenBank
是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。
2、Ensemble数据库可为药物研发提供超过167,000种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来,便于查询。Ensemble可从药品专利开始,再通过其临床前和临床研究资料,直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。数据库每月更新一次,每年增加约10,000
种新化合物。

㈤ DNA数据库的EMBL

欧洲生物信息学研究所(European
Bioinformatics
Institute,
EBI)创建的一个核酸序列数据库。EMBL的数据来源主要有两部分,一部分由科研人员或某些基因组测序机构通过计算机网络直接提交,另一部分则来自科技文献或专利(Stoesser等,
1998)。EMBL与DDBJ、GenBank建有合作关系,他们分别在全世界范围内收集核酸序列信息,每天都将新发现或更新过的数据相互交换。
DNA数据库的规模正在以指数方式增长,平均不到9个月就增加一倍。1998年1月,EMBL中收录的序列数已超过一百万,包括15,500个物种,其中模式生物的序列占50%以上,它们包括人类(Homo
sapiens),
线虫(Caenorhabditis
elegans),啤酒酵母(Saccharomyces
cerevisiae),小鼠(Mus
musculus)和拟南芥(Arabidopsis
thalania)。
可以利用序列查询系统
SRS(Sequence
Retrieval
System)从EMBL数据库中提取有关信息(Etzold等,1996年)。SRS序列查询系统通过超文本链接将DNA序列数据库和蛋白质序列、功能位点、结构、基因图谱以及文献摘要MEDLINE等各种数据库联系在一起。利用EBI网站提供的BLAST或FastA程序,可以对EMBL数据库进行未知序列同源性搜索。

㈥ 人的基因数据库和指纹数据库有哪些不同

人类手指上的皮肤和身体的皮肤有很大不同。其一,手指皮肤有凸纹,没有毛发,不会有油脂,但却有很多汗孔;其二,指纹具有唯一性和稳定性,随着年龄的增长指纹上虽然会起皱,但是图案基本不变;其三,人手接触各种物体表面通常会留下痕迹。这些特性就使得指纹特别适合做身份识别,也即我们所说的“指纹识别”。

美国夏威夷大学癌症研究中心研究发现:女性左手指箕形纹如果开口向右的纹形较多,患乳癌的机会可能较高。英国学者的研究证实:斗纹越多,越容易患高血压。美国纽约大学的研究发现:老年痴呆病人组中,十指中有8个指头为小指侧箕型的人占72%,而对照组中只有26%;病人组中有14人的十指全部为小指侧箕型指纹,而对照组中只有4人。专家同时说,这仅是统计学的调查资料,并不意味着凡是十指中有8个指头是小指侧箕型纹的人,都一定会患上老年性痴呆症。

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㈧ 已有基因序列,怎么在NCBI里获得基因登录号

填写上传的序列相关信息。Continue,进入Sequence Technology界面,继续填写基础信息,以我上传的序列转录组测序结果为例,illumina 二代测序技术,填完continue即可。

单位简介

国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information) 是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分(该图书馆是美国国家卫生研究所的一部分)。

许多受尊敬的研究者在NCBI工作, 如比较基因组学领域的一位多产的科学家Eugene Koonin和BLAST序列数据库搜索算法的作者Stephen Altschul。

㈨ 如何在网上找寻模式生物的基因组数据

玉米基因组在Science杂志中可以查找到。
去年年初,美国科学家成功测序得出了玉米基因组的草图,这是由测序项目负责人——圣路易斯华盛顿大学基因组测序中心主任理乍得·威尔逊在“玉米遗传学会议”第50次年会上公布的。科学家们以代号为B73的高产玉米品种为研究对象,完成了约95%的基因组测序工作。结果显示,玉米基因组的基因数量为5万至6万个,碱基对数量大约为20亿个。
基因组,一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列,包括全套基因和间隔序列。可是基因组测序的结果发现基因编码序列只占整个基因组序列的很小一部分。因此,基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。说的更确切些,核基因组是单倍体细胞核内的全部 DNA分子;线粒体基因组则是一个线粒体所包含的全部DNA分子;叶绿体基因组则是一个叶绿体所包含的全部DNA分子。中国研究人员成功破译高山倭蛙基因组 迄今为止破译的首个现代蛙类基因组。