A. 生物信息学与生态信息学有什么不同
生物信息学(Bioinformatics):
是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。
具体而言,生物信息学作为一门新的学科领域,它是把基因组DNA序列信息分析作为源头,在获得蛋白质编码区的信息后进行蛋白质空间结构模拟和预测,然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。基因组信息学,蛋白质空间结构模拟以及药物设计构成了生物信息学的3个重要组成部分。从生物信息学研究的具体内容上看,生物信息学应包括这3个主要部分:(1)新算法和统计学方法研究;(2)各类数据的分析和解释;(3)研制有效利用和管理数据新工具。 生物信息学是一门利用计算机技术研究生物系统之规律的学科。
目前的生物信息学基本上只是分子生物学与信息技术(尤其是因特网技术)的结合体。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据,其研究工具是计算机,研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)。
生态信息学或者信息生态学(Ecological Informatics):
是以现代系统理论、方法和现代计算机技术来分析、处理整日趋膨胀的试验和观测的生态学信息,寻求生态学系统整体水平的规律。专家们认为,现今世界科学研究的发展趋势的应该是强调整合和系统的整体论,而强调解析的还原论的结果通常是导致科学家对越来越小局部和的片断的越来越深的了解。对于象生态系统这样的复杂系统而言,仅仅了解系统的内部的局部环节远远不足以解释系统的行为,因为系统各部分(子系统)之间的相互作用在解释系统行为方面同等重要。专家们提出如下信息生态学优先研究领域。
1.生态学数据采集技术的规范化及数据库的系统化
在生态学数据的采集方法、技术、手段、及数据精度等方面,应尽量实现规范化和标准化,尽可能利 用新的数据传感技术(如近红外技 术),使之尽可能符合国际、国家。或者行业的标准,为后续的信息分析和处理打下良好的基础,为信息的交流传播和共享创造条件。鉴于数据生态学数据的形式、时空范围、获取背景等诸多方面的多样化,有必要对现有的生态学数据进 行系统化的整编、改造,使之能够 互相补充,互相印证。同时,有必要就上述问题展开方法和技术方面的研究。
2.生态系统信息分析与模型化以不同方法手段对生态学数据进行分析和处理,从中导出有关生态学规律
发展各种不同类型、不同尺度、不同层次的生态系统模型,通过对系统的模拟分析,从生态学数据中提取有关生态系统的行为和规律方面的信息。主要包括如下方面:①.生物群落的综合信息分析理论。发展包括环境、空间因素、生物要素在内的群落学多元统计分析方法将是信息生态学在群落分析方面的重要的潜在突破曰。②.基于过程的植物个体(包括农作物、森林树木)生长发育动态模拟模型。模拟不同气候、土壤条件下,植物个体各部分的生长。发育以及净第一性生产力、产量。材积形成的过程。③.森林群落结构动态模型。建立适合于我国特殊情况的(灾害频繁、人为活动干扰强度大等)森林群落物种演替动态模拟模型。④.空间耦合动态模拟模型理论、空间模拟软件系统。很有必要建立一个空间异质生态系统模拟的计算机环境,专门用于各种不同的空间异质生态系统的模拟模 型的建立。⑤.空间异质生态系统模拟模型。针对景观尺度和区域尺度的生态学问题,建立生态系统结构和功能耦合、空间格点耦合的双重耦合生态系统模拟模型。⑹.不同尺度生态系统模拟模型的尺度转换。
3.生态系统管理的信息化咨询与决策
结合理论模型和生态系统管理方面的定性的和定量的专家经验性知识,建立生态系统管理咨询与决策系统。关键问题包括:专家经验和知识的规范化和知识库建立。理论模型与专家经验的结合。研究有关的方法和技术,正确客观地处理理论模型结果和专家经验知识之间的矛盾。
尽管处理的科学问题不同、时空尺度不同,但生物信息学和信息生态学所用的信息分析工具却有许多是相同的或相近的。研究和发 展一些通用的信息工具是共同的需要。
生物信息学和信息生态学的研究需要发展有效的能支持大尺度作图与测序需要的软件和数据库以及若干数据库工具,包括互联网络上的远程通讯工具,使之能容易地处理日益增长的物理图、遗传图和序列信息、地理信息。改进现有的理论分析方法,如统计方法,隐含马尔科夫过程方法,非线性动力系统方法,特别是混浊和分维方法,神经网络方法,复杂性分析方法,密码学方法,多序列比较方法等;要研究系统自组织问题、熵或其它信息的测度问题,创建一切适用于基因组信息和信息生态学分析的新方法、新技术,包括引人复杂系统分析技术、信息系统分析技术等,例如,发展离散数学和组合数学相结合的方法;发展统计语言学和代数语言学相结合的方法;发展研究基因组完整信息结构和信 息网络的研究方法等。如近红外光谱技术、计算计视觉技术、图像和图形的识别技术的研究,也是非常重要的。这一切是我国生物信息学和信息生态学研究取得突破的技术保障。
B. Nutanix数据库的优点有哪些相比传统的数据库咋样啊
作为一个程序员我可以回答一下这个问题啊,当下许多组织还在使用几十年前的传统数据库平台。这些平台不仅需要手动操作和维护,而且成本高昂、操作复杂,很容易出现长时间宕机,甚至是数据泄露事故,这种事情在公司里是大事,抑制了公司的创新和发展的。
今年公司开始用Nutanix 推出的数据库,解决方案采取了全新而独特的方法,改变企业操作现有数据库生态系统的方式。Nutanix开发了一个平台,可通过一键式操作来虚拟化和整合所有数据库引擎,从而使数据库监控、优化和管理变得更加简便和快捷。我们增添了现代云就绪数据库即服务功能,可实现管理负载自动化,并消除大部分管理负载。数据库解决方案不仅表现出色,还能够满足业务需求,保持始终可用,并极具安全性和成本效益。希望我的回答能帮助到你,哈哈哈~~一个码农的一点见解。
C. 数据分析工具常见的有哪些
1、数据处理工具:Excel
数据分析师,在有些公司也会有数据产品经理、数据挖掘工程师等等。他们最初级最主要的工具就是Excel。有些公司也会涉及到像Visio,Xmind、PPT等设计图标数据分析方面的高级技巧。数据分析师是一个需要拥有较强综合能力的岗位,因此,在有些互联网公司仍然需要数据透视表演练、Vision跨职能流程图演练、Xmind项目计划导图演练、PPT高级动画技巧等。
在Excel,需要重点了解数据处理的重要技巧及函数的应用,特别是数据清理技术的应用。这项运用能对数据去伪存真,掌握数据主动权,全面掌控数据;Excel数据透视表的应用重在挖掘隐藏的数据价值,轻松整合海量数据:各种图表类型的制作技巧及Power Query、Power Pivot的应用可展现数据可视化效果,让数据说话。因此想从事数据分析岗位的,需要快速掌握快各种Excel数据处理与分析技巧。
2、数据库:Mysql
Excel如果能够玩的很转,能胜任一部分数据量不是很大的公司。但是基于Excel处理数据能力有限,如果想胜任中型的互联网公司中数据分析岗位还是比较困难。因此需要学会数据库技术,一般Mysql。你需要了解MySQL管理工具的使用以及数据库的基本操作;数据表的基本操作、MySQL的数据类型和运算符、MySQL函数、查询语句、存储过程与函数、触发程序以及视图等。比较高阶的需要学习MySQL的备份和恢复;熟悉完整的MySQL数据系统开发流程。
3、数据可视化:Tableau & Echarts
如果说前面2条是数据处理的技术,那么在如今“颜值为王”的现在,如何将数据展现得更好看,让别人更愿意看,这也是一个技术活。好比公司领导让你对某一个项目得研究成果做汇报,那么你不可能给他看单纯的数据一样,你需要让数据更直观,甚至更美观
如何理解数据可视化?像我们以前上学的时候学过的柱状图,饼状图,也是数据可视化的一种。只是在现在,简单的柱状图已经不能满足工作所需。目前比较流行的商业数据可视化工具是Tableau & Echarts。
Echarts是开源的,代码可以自己改,种类也非常丰富,这里不多做介绍,可以去创建一个工作区了解下。
4、大数据分析:SPSS & Python& HiveSQL 等
如果说Excel是“轻数据处理工具”,Mysql是“中型数据处理工具”那么,大数据分析,涉及的面就非常广泛,技术点涉及的也比较多。这也就是为什么目前互联网公司年薪百万重金难求大数据分析师的原因
大数据分析需要处理海量的数据,这对于数据分析师的工作能力要求就比较高,一般来说,大数据分析师需要会
(1)会使用Hive的SQL方法HiveQL来汇总、查询和分析存储在Hadoop分布式文件系统上的大数据集合。知道Hive如何在Hadoop生态系统进行数据分析工作。
(2)会一些SPSS modeler基础应用,这部分技能对应数据建模分析师
(3)何使用R语言进行数据集的创建和数据的管理等工作;会使用R语言数据可视化操作,让学员学会如何用R语言作图,如条形图、折线图和组合图等等;是R语言数据挖掘,本部分数据挖掘工程师
(4)用Python来编写网络爬虫程序,从页面中抓取数据的多种方法,提取缓存中的数据,使用多个线程和进程来进行并发抓取等
总结一下
D. hadoop和mangoDb用作大数据分析哪个更好
1,hadoop是大数据分析的完整生态系统,从数据采集,存储,分析,转运,再到页面展示,构成了整个流程采集可以用flume,存储用hbase,hdfs,mangodb就相当于hbase,分析用Maprece自己写算法,还有hive做数据仓库,pig做数据流处理,转储方面有sqoop,可以将hdfs中的数据转换存储到mysql,oracle等传统数据库,这就构成了一整套大数据分析的整个流程
2,mangodb只是充当存储功能,是一款nosql数据库,支持以json的格式存储
3,所以从功能上来讲,hadoop和mangodb是不一样的,hadoop中可以用mangodb替换hbase,但是mangodb不能替换hadoop,一个是完整的生态系统,一个是数据库,两个不一样的概念
4,至于选择用mangodb还是hbase,各有优劣,不过使用较多的还是hbase,mangodb社区没有hbase活跃,所以还是hbase吧
E. 介绍几个国产数据库
当前数据库生态可以大致分类三类:
一是传统商业数据库,以 Oracle 为代表,其在 40 余年时间里所创造的数据库帝国已拥有了极其完善的生态;
二是开源数据库,以 MySQL、PostgreSQL 为代表,遍布全球的社区组织形成了强大的生态系统,也形成了若干分支,成就了诸多商业数据库产品;
第三则是国内新兴数据库,以 TiDB、OceanBase、PolarDB 等为代表,具备较强的自研能力,但在生态方面较前两类薄弱很多。如何快速建立并形成符合自身利益的生态呢?开源无疑是一个绝佳的选择。
F. 大数据正在如何改变数据库格局
大数据正在如何改变数据库格局
提及“数据库”,大多数人会想到拥有30多年风光历史的RDBMS。然而,这可能很快就会发生改变。
一大批新的竞争者都在争夺这一块重要市场,他们的方法是多种多样的,却都有一个共同点:极其专注于大数据。推动新的数据迭代衍生品大部分都是基于底层大数据的3V特征:数量,速度和种类。本质上来讲,今天的数据比以往任何时候都要传输更快,体积更大, 同时更加多样化。这是一个新的数据世界,换言之,传统的关系数据库管理系统并没有真正为此而设计。“基本上,他们不能扩展到大量,或快速,或不同种类的数据。”一位数据分析、数据科学咨询机构的总裁格雷戈里认为。这就是哈特汉克斯最近发现。截至到2013年左右,营销服务机构使用不同的数据库,包括Microsoft SQL Server和Oracle真正应用集群(RAC)的组合。“我们注意到,数据随着时间的增长,我们的系统不能足够快速的处理信息”一位科技发展公司的负责人肖恩说到。“如果你不断地购买服务器,你只能继续走到这幺远,我们希望确保自己有向外扩展的平台。”最小化中断是一个重要的目标,Iannuzzi说到,因此“我们不能只是切换到Hadoop。”相反,却选择了拼接机器,基本上把完整的SQL数据库放到目前流行的Hadoop大数据平台之上,并允许现有的应用程序能够与它连接,他认为。哈特汉克斯现在是在执行的初期阶段,但它已经看到了好处,Iannuzzi说,包括提高容错性,高可用性,冗余性,稳定性和“性能全面提升”。一种完美风暴推动了新的数据库技术的出现,IDC公司研究副总裁Carl Olofson说到。首先,“我们正在使用的设备与过去对比,处理大数据集更加快速,灵活性更强”Olofson说。在过去,这样的集合“几乎必须放在旋转磁盘上”,而且数据必须以特定的方式来结构化,他解释说。现在有64位寻址,使得能够设置更大的存储空间以及更快的网络,并能够串联多台计算器充当单个大型数据库。“这些东西在不可用之前开辟了可能性”Olofson说。与此同时,工作负载也发生了变化。10年前的网站主要是静态的,例如,今天我们享受到的网络服务环境和互动式购物体验。反过来,需要新的可扩展性,他说。公司正在利用新的方式来使用数据。虽然传统上我们大部分的精力都放在了对事务处理 – 销售总额的记录,比如,数据存储在可以用来分析的地方 – 现在我们做的更多。应用状态管理就是一个例子假设你正在玩一个网络游戏。该技术会记录你与系统的每个会话并连接在一起,以呈现出连续的体验,即使你切换设备或各种移动,不同的服务器都会进行处理,Olofson解释说。数据必须保持连续性,这样企业才可以分析问题,例如“为什么从来没有人穿过水晶厅”。在网络购物方面,为什么对方点击选择颜色后大多数人不会购买某个特殊品牌的鞋子。“以前,我们并没试图解决这些问题,或者我们试图扔进盒子也不太合适”Olofson说。Hadoop是当今新的竞争者中一个重量级的产品。虽然他本身不是一个数据库,它的成长为企业解决大数据扮演关键角色。从本质上讲,Hadoop是一个运行高度并行应用程序的数据中心平台,它有很强的可扩展性。通过允许企业扩展“走出去”的分布方式,而不是通过额外昂贵的服务器“向上”扩展,“它使得我们可以低成本地把一个大的数据集汇总,然后进行分析研究成果”Olofson说。其他新的RDBMS的替代品如NoSQL家族产品,其中包括MongoDB -目前第四大流行数据库管理系统,比照DB引擎和MarkLogic非结构化数据存储服务。“关系型数据库一直是一项伟大的技术持续了30年,但它是建立在不同的时代有不同的技术限制和不同的市场需求,”MarkLogic的执行副总裁乔·产品帕卡说。大数据是不均匀的,他说。许多传统的技术,这仍然是一个基本要求。“想象一下,你的笔记本电脑上唯一的程序是Excel”帕卡说。“设想一下,你要和你的朋友利用网络保持联系 – 或者你正在写一个合约却不适合放进行和列中。”拼接数据集是特别棘手的“关系型,你把所有这些数据集中在一起前,必须先决定如何去组织所有的列,”他补充说。“我们可以采取任何形式或结构,并立即开始使用它。”NoSQL数据库没有使用关系数据模型,并且它们通常不具有SQL接口。尽管许多的NoSQL存储折中支持速度等其他因素,MarkLogic为企业定身量做,提供更为周全的选择。NoSQL储存市场有相当大的增长,据市场研究媒体,不是每个人都认为这是正确的做法-至少,不是在所有情况下。NoSQL系统“解决了许多问题,他们横向扩展架构,但他们却抛出了SQL,”一位CEO-Monte Zweben说。这反过来,又为现有的代码构成问题。Splice Machine是一家基于Hadoop的实时大数据技术公司,支持SQL事务处理,并针对OLAP 和OLAP应用进行实时优化处理。它被称为替代NewSQL的一个例子,另一类预期会在未来几年强劲增长。“我们的理念是保持SQL,但横向扩展架构”Zweben说。“这是新事物,但我们正在努力试图使它让人们不必重写自己的东西。”深度信息科学选择并坚持使用SQL,但需要另一种方法。公司的DeepSQL数据库使用相同的应用程序编程接口(API)和关系模型如MySQL,意味着没有应用变化的需求而使用它。但它以不同的方式处理数据,使用机器学习。DeepSQL可以自动适应使用任何工作负载组合的物理,虚拟或云主机,该公司表示,从而省去了手动优化数据库的需要。该公司的首席战略官Chad Jones表示,在业绩大幅增加的同时,也有能力将“规模化”为上千亿的行。一种来自Algebraix数据完全不同的方式,表示已经开发了数据的第一个真正的数学化基础。而计算器硬件需在数学建模前建成,这不是在软件的情况下,Algebraix首席执行官查尔斯银说。“软件,尤其是数据,从未建立在数学的基础上”他说,“软件在很大程度上是语言学的问题。”经过五年的研发,Algebraix创造了所谓的“数据的代数”集合论,“数据的通用语言”Silver说。“大数据肮脏的小秘密是数据仍然放在不与其他数据小仓融合的地方”Silver解释说。“我们已经证明,它都可以用数学方法来表示所有的集成。”配备一个基础的平台,Algebraix现在为企业提供业务分析作为一种服务。改进的性能,容量和速度都符合预期的承诺。时间会告诉我们哪些新的竞争者取得成功,哪些没有,但在此期间,长期的领导者如Oracle不会完全停滞不前。“软件是一个非常时尚行业”安德鲁·门德尔松,甲骨文执行副总裁数据库服务器技术说。“事情经常去从流行到不受欢迎,回再次到流行。”今天的许多创业公司“带回炒冷饭少许抛光或旋转就可以了”他说。“这是一个新一代孩子走出学校和重塑的东西。”SQL是“唯一的语言,可以让业务分析师提出问题并得到答案,他们没有程序员,”门德尔松说。“大市场将始终是关系型。”至于新的数据类型,关系型数据库产品早在上世纪90年代发展为支持非结构化数据,他说。在2013年,甲骨文的同名数据库版本12C增加了支持JSON(JavaScript对象符号)。与其说需要一个不同类型的数据库,它更是一种商业模式的转变,门德尔松说。“云,若是每个人都去,这将破坏这些小家伙”他说。“大家都在云上了,所以在这里有没有地方来放这些小家伙?“他们会去亚马逊的云与亚马逊竞争?” 他补充说。“这将是困难的。”甲骨文有“最广泛的云服务”门德尔松说。“在现在的位置,我们感觉良好。”Gartner公司的研究主任里克·格林沃尔德,倾向于采取了类似的观点。“对比传统强大的RDBMS,新的替代品并非功能齐全”格林沃尔德说。“一些使用案例可以与新的竞争者来解决,但不是全部,并非一种技术”。展望未来,格林沃尔德预计,传统的RDBMS供货商感到价格压力越来越大,并为他们的产品增加新的功能。“有些人会自由地带来新的竞争者进入管理自己的整个数据生态系统”他说。至于新的产品,有几个会生存下来,他预测“许多人将被收购或资金耗尽”。今天的新技术并不代表传统的RDBMS的结束,“正在迅速发展自己”IDC的Olofson。赞成这种说法,“RDBMS是需要明确定义的数据 – 总是会有这样一个角色。”但也会有一些新的竞争者的角色,他说,特别是物联网技术和新兴技术如非易失性内存芯片模块(NVDIMM)占据上风。以上是小编为大家分享的关于大数据正在如何改变数据库格局的相关内容,更多信息可以关注环球青藤分享更多干货
G. 中国生态系统评估与生态系统安全数据库中的土壤侵蚀图资料是哪一年的
是2010年的~
H. 数据库管理系统是什么,对企业有何影响
数据库计算机应中专门管理数据。数据多种形式,例如文字数字符号图形图像和声音。数据所计算机处理内容。一个众所周知处理制作一个文件
I. GO 和 KEGG 的区别
1、属性不同
Go(又称 Golang)是 Google 的 Robert Griesemer,Rob Pike 及 Ken Thompson 开发的一种静态强类型、编译型语言。功能:内存安全,GC(垃圾回收),结构形态及 CSP-style 并发计算。
KEGG 是了解高级功能和生物系统(如细胞、 生物和生态系统),从分子水平信息,尤其是大型分子数据集生成的基因组测序和其他高通量实验技术的实用程序数据库资源,是国际最常用的生物信息数据库之一,以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”着称。
2、性质不同
go是计算机编程语言。
KEGG基因组破译方面的数据库。
(9)生态系统数据库扩展阅读:
Go的语法接近C语言,但对于变量的声明有所不同。Go支持垃圾回收功能。Go的并行模型是以东尼·霍尔的通信顺序进程(CSP)为基础,采取类似模型的其他语言包括Occam和Limbo。
但它也具有Pi运算的特征,比如通道传输。在1.8版本中开放插件(Plugin)的支持,这意味着现在能从Go中动态加载部分函数。
与C++相比,Go并不包括如枚举、异常处理、继承、泛型、断言、虚函数等功能,但增加了 切片(Slice) 型、并发、管道、垃圾回收、接口(Interface)等特性的语言级支持。Go 2.0版本将支持泛型,对于断言的存在,则持负面态度,同时也为自己不提供类型继承来辩护。
不同于Java,Go内嵌了关联数组(也称为哈希表(Hashes)或字典(Dictionaries)),就像字符串类型一样。
KEGG是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库。把从已经完整测序的基因组中得到的基因目录与更高级别的细胞、物种和生态系统水平的系统功能关联起来是KEGG数据库的特色之一。
人工创建了一个知识库,这个知识库是基于使用一种可计算的形式捕捉和组织实验得到的知识而形成的系统功能知识库。它是一个生物系统的计算机模拟。
与其他数据库相比,KEGG 的一个显着特点就是具有强大的图形功能,它利用图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系,这样可以使研究者能够对其所要研究的代谢途径有一个直观全面的了解。