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染色体的信息在哪个数据库可以查

发布时间: 2022-08-24 15:02:42

Ⅰ 已知一个基因如何查找在哪个染色体上

根据文献中已知的基因ID如果你在文献中看到你感兴趣的基因,而且文中还提到了
基因在Genbank中的ID号,那就好办了,直接打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov ,在Search后的下拉框中选择Nucleotide,把Genbank ID号输入GO前面的文本框中,点“GO”,就可以找到了。(如GenBank accession number gi 16151096)”。
2. 根据已经获得的基因的相关信息进行查找,打开http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在search后面的下拉框中选择Gene,然后在中间的文本框中输入基因名称“VEGF”,点击GO。搜索结果出来了,点击箭头所指的Limits, Limits的意思其实就是高级检索,你可以在这里对检索词进行很多限制,这样能大大精简查询结果。我们接着来,在Limits这个界面,先选择查询的限定范围:先选Gene name(基因名称);然后再选择Limit by Taxonomy(生物分类限定)中的Homo sapiens(人类),然后再点击“GO”。直接点击基因名称“VEGFA”就可以看到有关基因的信息了。需要指出的是,在Genbank中,基因有很多别名(Aliases),和Genbank中记录的名称有可能不一致。比如在这里,VEGFA是Genbank中记录的基因名称,而它还有很多别名,比如MGC70609, VEGF(这就是我们要找的基因名称 ), VEGF-A, VPF;还有,在这里可以看到该基因在染色体上的位置... 再往下看,可以看到Genomic regions, transcripts, and procts,这里显示了该基因在基因组中的位置,以及转录本的生成情况:就看见了目的基因的mRNA的链接(如NM_001025366.1)和蛋白质的链接(如NP_001020537.2 ) 这里得说两句,有的基因也许只有一个编码序列,但有的基因有很多的mRNA剪接体,但都是归在一个基因名称下面。比如,在VEGF基因下面有7个序列,分别是vascular endothelial growth factor A isoform a, isoform c, isoform d, isoform e, isoform f , isoform g, isoform b precursor ,就需要根据查阅的文献以及在这些基因序列后面的解释来确定了。如果我想找的基因是第一个序列即isoform a, 就可以点击NM_001025366.1

Ⅱ ncbi下载基因位置信息

针对你的要求,觉得 http://www.genecards.org/ 比NCBI要好用些
要下载整套数据库是不可能的,只能查寻。你到genecards或者NCBI上输入所要查询的基因名称或者编号。位置了,序列了,功能了,还有目前可用的试剂都可以查到的.
不过genecards只有人的。NCBI上可以查到其他动物的。

譬如,你要查人的p21基因。那就到这里
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1026
你要求的“已知基因的位置(在哪个染色体,具体位置是什么),大概功能等等“都有了

Ⅲ 自己如何查decipher数据库

有以下多种查看方式:
1. Genome browser通过基因组浏览器来查看染色体特定位置,特定基因或者cytoband区域的变异分布情况。
2. Phenotype browser,可以查看各种表型对应的信息。
3. Genes,以基因为单位,展示了与疾病表型相关的基因组变异所在的基因。
4. CNV Syndromes,展示了与发育障碍综合征相关的CNV变异。
5. Gene Disorders,clinvar数据库中与表型相关的基因变异信息。

Ⅳ 有没有可以直接查植物染色体数目的数据库谢谢解答!

网页链接

CCDB server - Chromosome Counts Database

Ⅳ 知道在染色体上的位置,如何查出那段基因序列

到NCBI网站,查人的基因组,找到关注的染色体就可以。

在染色体上获取目的基因要用到限制性核酸内切酶,根据目的基因的基因序列来选择相应的限制性核酸内切酶,限制性核酸内切酶就能切割出所需的目的基因了,并且根据切割的末端又可以分为粘性末端和平末端。

用于DNA基因组物理图谱的组建;基因的定位和基因分离;DNA分子碱基序列分析;比较相关的DNA分子和遗传工程。

限制性核酸内切酶是由细菌产生的,其生理意义是提高自身的防御能力。

限制酶一般不切割自身的DNA分子,只切割外源DNA。

(5)染色体的信息在哪个数据库可以查扩展阅读:

DNA分子类似“计算机磁盘”,拥有信息的保存、复制、改写等功能。将人体细胞核中的23对染色体中的DNA分子连接起来拉直,其长度大约为0.7米,但若把它折叠起来,又可以缩小为直径只有几微米的小球。因此,DNA分子被视为超高密度、大容量的分子存储器。

基因芯片经过改进,利用不同生物状态表达不同的数字后还可用于制造生物计算机。基于基因芯片和基因算法,未来的生物信息学领域,将有望出现能与当今的计算机业硬件巨头――英特尔公司、软件巨头――微软公司相匹敌的生物信息企业。

Ⅵ 如何在NCBI上下载基因在染色体上的信息

首先,基因名输入到NCBI官网,将窗口调至gene选项,点击进入;
其次找到该种属的基因,点击进入
然后点击genebank,就能看到该基因的详细信息以及在染色体上的信息。

Ⅶ 在pubmed上猪的Y染色体STR怎么查

首先pubmed 数据库没有猪这种动物的str 但是利用所有数据库的时候可以查到很多。你可以利用高级检索(advanced search)查找。首先,在Search Builder上输入chromosomes y然后点aad to
search box 按钮;然后继续在Search Builder上输入str,再点上一步的按钮;然后输入pig 点那个按钮。当然结果是0,那是因为你的数据库选择仅仅是pubmed,你在search的下拉窗口中选择alldatabase,就会出现很多数据库,开头有数字的就是有相应数字的检索结果;开头为none的是没有检索结果。
这还没完pig只是猪的一种称谓,学术上也不会只用这种名词,所以搜索时第三步的pig可以替代为hog,swine,Sus scrofa domestica Brisson,Sus ,Sus scrofa ,Sus domesticus等。pubmed不支持中文搜索,所以只能用英文搜。希望能够帮到你。

Ⅷ 番茄数据库如何找染色体长度

在UCSC的主页上,点击Genomics,然后点击human图标,获取其他物种的染色体长度。
染色体(chromosome)是细胞在有丝分裂或减数分裂时DNA存在的特定形式。细胞核内,DNA紧密卷绕在称为组蛋白的蛋白质周围并被包装成一个线状结构。当细胞不分裂时,染色体在细胞核中是不可见的——在显微镜下也是如此。