1. Web頁面如何調用R語言腳本
最簡單的方法就是每次引用時把寫好的函數復制一下,到R console 中,然後寫其他的。然後,編好的函數寫成.r 文件,下次直接使用命令 source(function.r)就能導入使用了。
2. r語言生成html文件怎麼演示
1、首先根據已有函數自定義函數,並製作表格。定義一個函數,輸入數據集的變數並得到該變數的統計結果。
2、其次函數定義完成後,建立一個空的列表,以儲存每個變數的分析結果,並進行分析,將結果儲存在列表中。
3、然後將所有結果merge到一個矩陣中,並建立rgroup(table1第一列的變數名) 和 n.rgroup(table 1第一列每個變數的行數)。
4、最後就一鍵生成html表格了。
3. 基於R語言的數據標准化處理腳本
基於R語言的數據標准化處理腳本
數據標准化(Normalization)
將數據按比例縮放,使之落入一個小的特定區間。去除數據的單位限制,將其轉化為無量綱的純數值,便於不同單位或量級的指標能夠進行比較和加權。
數據標准化處理主要包括數據同趨化處理和無量綱化處理兩個方面。
數據同趨化處理主要解決不同性質數據問題,對不同性質指標直接加總不能正確反映不同作用力的綜合結果,須先考慮改變逆指標數據性質,使所有指標對測評方案的作用力同趨化,再加總才能得出正確結果。
數據無量綱化處理主要解決數據的可比性。數據標准化的方法有很多種,常用的有「最小—最大標准化」、「Z-score標准化」和「按小數定標標准化」等。經過上述標准化處理,原始數據均轉換為無量綱化指標測評值,即各指標值都處於同一個數量級別上,可以進行綜合測評分析。
min-max標准化(Min-max normalization)
也叫離差標准化,是對原始數據的線性變換,使結果落在[0,1]區間,轉換函數如下:
正向指標:(x-min)/(max-min)
負向指標:(max-x)/(max-min)
其中max為樣本數據的最大值,min為樣本數據的最小值。這種方法有一個缺陷就是當有新數據加入時,可能導致max和min的變化,需要重新定義。
R語言實現
# 標准化處理
min.max.norm <- function(x){
((x-min(x))/(max(x)-min(x)))
} #正向指標
max.min.norm <- function(x){
((max(x)-x)/(max(x)-min(x)))
} #負向指標
data_1 <- apply(data[,-c(3,4)],2,min.max.norm) #正向指標處理
data_2 <- apply(data[,c(3,4)],2,max.min.norm) #負向指標處理
#注意array只能用在二維及以上
data_t <- cbind(data_1,data_2)
4. R語言作業輔導老師有嗎
R語言作業作業涉及的問題如下:
1、R和RStudio,以及模型問題的生物學背景和課程中使用的特定機器學習方法。
2、R編程模型,以及如何在實踐中使用R語言編寫腳本。
3、如何使用R和Shiny構建互動式圖形應用程序,如何使用R開發復雜的關系數據。
4、如何在R中導入和處理數據(數據清理和整理)。
5、如何使用集群計算(使用Apache Spark)運行互動式工作流。
6、數據可視化和結果繪圖(例如使用ggplot2),以及如何在特定生物學問題的背景下解釋分析結果。
5. r語言編程的步驟
r語言編程的步驟?R是用於統計分析、繪圖的語言和操作環境。R是屬於GNU系統的一個自由、免費、源代碼開放的軟體,它是一個用於統計計算和統計制圖的優秀工具。
工具原料一台電腦下載完畢的R software
方法/步驟分步閱讀
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安裝完畢R語言,新建屬於自己的R變成文件夾,然後 File ->Change Dir..,設置成自己的工作文件,自己工作空間將都會產生在這個文件夾下。
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然後Files - > New Script,打開新的腳本編輯,在這里鍵入自己代碼,編輯。
在此模式下,摁F5鍵意味著執行這一行,當我們編輯很多行的時候,我們可以進行全選,然後摁下F5,這樣就會執行所有行的代碼。
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下面進行實戰,我們下面將會用R語言畫出一個簡單房子,具體的代碼含義不解釋,推薦Manning出版的《R語言實戰》,裡面有大量的聯系及講解。
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選中,然後執行F5按鍵,R語言就會畫出一個簡單的房子,具體代碼可以參見下圖。
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總之,R語言是一個非常好的統計軟體,在生物統計,金融統計中發揮著越來越多的作用,同時R語言作為一款開源軟體,也被世界的R語言興趣者優化著。
注意事項
R作為一款免費的軟體,有時候即使編正確的情況下,仍然可能出現錯誤
軟體的學習在於多聯系
內容僅供參考並受版權保護
6. R語言細節匯總
開始一個新的R語言數據分析新項目,管理腳本、圖片、文件的推薦方式:打開Rstudio,新建Rproject,新建腳本(腳本存放在生成的Rproject文件夾中)。
若要逆著優先順序操作,將返回NA
x %in%y是判斷x中的每一個元素是否在y中存在。
若x和y長度不一致,返回x個TRUE或者FALSE。
⚠️練習:按如下方式生成test數據框,提取test中,最後一列值為a或c的行,組成一個新的數據框,賦值給test2。
這里如果使用==來判斷,就相當於拿test$n的15個值與c('a','c')的2個值來一一對應著比對,因為兩者長度不同,會發生循環補齊,其效果如下圖,明顯不是我們想要的結果。
x%in%y:選出x是y中一個值時的所有行
另:取交集、差集、並集的函數為:intersect(x,y)、union(x,y)、setdiff(x,y)、setdiff(y,x)
match函數的用法參考: https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/84927296
使用match函數修改矩陣的信息
方法1--設置CRAN鏡像:打開R studio,點擊tools--global option--packages,選擇Package CRAN reposotory。
方法2--設置CRAN和bioconctor鏡像
用於讀取/導出文件的R包
rio可以不用區分讀入文件類型,大部分文件可直接用import()讀取。
@ 是R中,S4類的一個操作符, 用於提取S4對象中的內容(slot) ,比如:
這個時候$是不起作用的,因為被S4類重寫了。可以自己定義$的行為。
⚠️: matrix不能直接用$取列
⚠️因此如果想取數據框中的部分行,在方括弧中直接輸入行數即可,返回的仍然是數據框。但如果加了逗號,會喪失數據框的格式,也就是會使數據框的行名(往往是基因名)丟失。
後面存圖時可以用paste0連接GSE編號和圖片類型及後綴,這樣不同數據的分析得到的圖片名就跟數據相一致。
通過將變數因子化來設置柱條的順序
7. r語言如何運行腳本
rstudio可以運行腳本,腳本文件格式一般為rscript,打開腳本,選擇程序,點擊run按鈕即可運行。
8. python如何調用執行R語言腳本
要用rpy2包的數據包,python才能調用R語言。