A. 引物設計必須從序列的最前端開始嗎
目的基因一般都上萬bp,兩頭開始。
這個問題很簡單,擴增序列應該稱為目的基因,目的基因一般都上萬bp,從兩頭開始當然不合適。PCR擴增只能擴增出上下游引物之間的序列,因為只有引物之間的DNA雙鏈是解鏈狀態的。
看引物設計的位置在哪裡了,一般來說擴增的片段都是兩條引物中間的那段模板。
你用擴增的引物測序的話,最好是雙向測序。或者,重新合成引物進行測序會比較好,測序引物的純化要求較高,而且引物片段不能大於20多個bp。
B. 如何將後台傳來的json反序列化為前端具體對象
//jQuery方式var obj = $.parseJSON(json);....//evalvar obj = eval("("+json+")");//下載json2.jsvar obj = JSON.parse(json);
C. 關於多聚核糖體 第一個核糖體識別前端的SD序列 後面接上去的核糖體如何識別mRNA
不是這樣理解的.
核糖體都是從mRNA的SD序列開始識別的.然後隨著翻譯的進行,離開SD序列,核糖體逐漸向下游移動,合成多肽鏈.緊隨其後的核糖體又可以繼續識別SD序列了.
核糖體,識別SD序列後,是會沿著mRNA移動的,就讓出了SD序列,不是一直結合著SD序列的.就這樣,隨著每個核糖體向下游移動翻譯多肽鏈,結合的核糖體就越來越多,形成多聚核糖體.
D. RNA-seq名詞解釋(1)
RNA-seq即 轉錄組測序 技術,就是用 高通量測序 技術進行測序分析,反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中一些的表達水平。RNA測序最經常用於分析差異表達基因(DEG)。
轉錄組 是某個物種或者特定細胞類型產生的所有轉錄本的集合。轉錄組研究能夠從整體水平研究基因功能以及 基因結構 ,揭示特定生物學過程以及疾病發生過程中的分子機理,已廣泛應用於基礎研究、臨床診斷和葯物研發等領域。
gene :具有編碼蛋白質或決定某一性狀作用的一段核酸序列。
Q20,Q30 :Phred 數值大於 20、30 的鹼基占總體鹼基的百分比,其中
Phred=-10log10(e).
intron :內含子,是真核生物細胞 DNA 中的間插序列。這些序列被
轉錄在前體 RNA 中,經過剪接被去除,最終不存在於成熟 RNA 分
子中。術語內含子也指編碼相應 RNA 內含子的 DNA 中的區域。
exon :外顯子,是真核生物基因的一部分,它在剪接(Splicing)後仍會被保存下來,並可在蛋白質生物合成過程中被表達為蛋白質。外顯子是最後出現在成熟 RNA 中的基因序列,又稱表達序列。既存在於最初的轉錄產物中,也存在於成熟的 RNA 分子中的核苷酸序列。術語外顯子也指編碼相應 RNA 外顯子的 DNA 中的區域。
intergenic :基因間區,指基因與基因之間的間隔序列,不屬於基因結構,不直接決定氨基酸,可能通過轉錄後調控影響性狀的區域。
UTR :Untranslated Regions, 非翻譯區域。是信使 RNA(mRNA)分子兩端的非編碼片段。5'-UTR 從 mRNA 起點的甲基化鳥嘌呤核苷酸帽延伸至 AUG 起始密碼子,3'-UTR 從編碼區末端的終止密碼子延伸至多聚 A 尾巴(Poly-A)的前端。
transcript :轉錄本,是由一條基因通過轉錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質的成熟的 mRNA。一條基因通過內含子的不同剪接可構成不同的轉錄本。
isoform :同一個基因經可變剪切或內含子選擇機制產生不同的轉錄本,這些不同轉錄本即稱 isoform。 reconstruction:重組,由於不同 DNA 鏈的斷裂和連接而產生 DNA片段的交換和重新組合,從而形成新 DNA 分子。plus strand/minus strand:正鏈/負鏈。對於一個基因來說,DNA 的兩條鏈中有一條鏈作為 RNA 合成時的模板,這條鏈叫負鏈,另一條叫正鏈。
antisense strand/sense strand :無義鏈/有義鏈。模板鏈在雙鏈 DNA中,用來轉錄 mRNA 的 DNA 鏈稱為模板鏈(template strand),不用於轉錄的鏈則稱為非模板鏈(nontemplate strand)。根據鹼基互補配對原則,轉錄出的 mRNA 鏈的鹼基序列與非模板鏈的鹼基序列一致,惟一不同的是,非模板鏈中的 T 在 mRNA 鏈中全部置換成了 U。正是由於非模板鏈的鹼基序列實際上代表了 mRNA 的鹼基序列(只不過在 mRNA 中 T 換成了 U),因此非模板鏈又被稱為編碼鏈(coding strand),有義鏈(sense strand)和克里克鏈(crick strand),而用來轉錄mRNA 的 DNA 鏈被稱為非編碼鏈(anticoding strand)或無義(antisense strand)或沃森鏈(watson strand)。
gene family :基因家族。真核細胞中,許多相關的基因常按功能成套組合,被稱為基因家族。它們來源於同一祖先,由一個基因通過基因重復產生兩個或更多的拷貝而構成的一組基因,它們在結構和功能上具有明顯的相似性,編碼相似的蛋白質產物。
gtf/gff :基因結構注釋文件。gtf(gene transfer format)指包含基因特
征的注釋文件,而 gff(general feature format)是指包含基因組特徵
的注釋文件。
ORF :open reading frame,開放閱讀框或開放讀碼框。是結構基因的正常核苷酸序列,從起始密碼子到終止密碼子的閱讀框可編碼完整的
多肽鏈,其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。
reference genome/ reference :參考基因組。RNA-seq 有參分析的基礎。
small RNA :是長度大約在 18-30bp 的非編碼 RNA 分子,包括 micro RNAs、siRNAs 和 pi RNAs,是生命活動重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要作
用。
ncRNA :non-coding RNA,非編碼 RNA。指不編碼蛋白質的 RNA。其中包括 rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和 microRNA 等多種已知功能的 RNA,及未知功能的 RNA。其共同特點是都能從基因組上轉錄而來,不需要翻譯成蛋白即可在 RNA 水平上行使各自的生物學功能。
lncRNA :long noncoding RNA,長鏈非編碼 RNA。長度在 200-100000nt之間,不具有編碼蛋白功能的轉錄本。根據與編碼基因的位置關系可分為:Antisense lncRNA (反義長非編碼 RNA)、Intronic lncRNA (內含子長非編碼 RNA)、Long intergenic noncoding RNA (基因間區長非編碼 RNA)、Sense lncRNA(正義長非編碼 RNA)、Bidirectional lncRNA(雙向長非編碼 RNA)。
參考鏈接:
RNA-seq_網路 (.com)
E. Web前端工程師應該知道的提高JavaScript技能的技巧!
今天小編要跟大家分享的文章是關於Web前端工程師應該知道的提高JavaScript
技能的技巧!熟悉web前端工作的小夥伴都知道,JavaScript是前端工程師的必備技能。JavaScript
是一種復雜的語言。如果是你是高級或者初級web開發人員,了解它的基本概念非常重要。本篇文章小編就為大家介紹幾種提高JavaScript
技能的技巧,下面讓我們一起來看一看吧!
01、變數賦值(值vs引用)
理解JavaScript如何給變數賦值可以幫助我們減少一些不必要的bug。如果你不理解這一點,可能很容易地編寫被無意中更改值的代碼。
JavaScript總是按照值來給變數賦值。這一部分非常重要:當指定的值是JavaScript的五種基本類型之一(即
Boolean,null,undefined,String和Number)時,將分配實際值。但是,當指定的值是
Array,Function或Object時,將分配對內存中對象的引用給變數。
在以下代碼段中,使用var1對var2進行賦值。由於var1是基本類型(String),因此var2的值等於var1的String
值,並且可以認為此時與var1完全不同。因此,重新賦值var2對var1沒有影響。letvar1='Mystring'
letvar2=var1;
var2='Mynewstring'
console.log(var1);
//'Mystring'
console.log(var2);
//'Mynewstring'
接著,與對象賦值進行比較。letvar1={name:'Jim'}
letvar2=var1;
var2.name='John'
console.log(var1);
//{name:'John'}
console.log(var2);
//{name:'John'}
如果你期望它會像原始類型賦值那樣,很可能會出問題!如果你創建了一個無意中會改變對象的函數,就會出現一些非預期的行為。
02、閉包
閉包是一個重要的JavaScript模式,可以私有訪問變數。在本例中,createGreeter返回一個匿名函數,這個函數可以訪問參數
greeting(在這里是「Hello」)。在後續的調用中,sayHello將有權訪問這個greeting!functioncreateGreeter(greeting){
returnfunction(name){
console.log(greeting+','+name);
}
}
constsayHello=createGreeter('Hello');
sayHello('Joe');
//Hello,Joe
在更真實的場景中,你可以設想一個初始函數apiConnect(apiKey),它返回一些使用APIkey的方法。在這種情況下,apiKey
只需要提供一次即可。functionapiConnect(apiKey){
functionget(route){
returnfetch(`${route}?key=${apiKey}`);
}
functionpost(route,params){
returnfetch(route,{
method:'POST',
body:JSON.stringify(params),
headers:{
'Authorization':`Bearer${apiKey}`
}
})
}
return{get,post}
}
constapi=apiConnect('my-secret-key');
//
api.get('#/get-endpoint');
api.post('#/post-endpoint',{name:'Joe'});
03、解構
JavaScript參數解構可以從對象中干中提取所需屬性的常用方法。constobj={
ame:'Joe',
food:'cake'
}
const{name,food}=obj;
console.log(name,food);
//'Joe''cake'
如果要以其他名稱提取屬性,可以使用如下方式:constobj={
ame:'Joe',
food:'cake'
}
const{name:myName,food:myFood}=obj;
console.log(myName,myFood);
//'Joe''cake'
解構經常也用於直接用於提取傳給函數的參數。如果你熟悉React,可能已經見過這個:constperson={
ame:'Eddie',
age:24
}
functionintroce({name,age}){
console.log(`I'm${name}andI'm${age}yearsold!`);
}
console.log(introce(person));
//"I'mEddieandI'm24yearsold!"
04、展開運算
ES6的一個常用之一的特性就是展開(...)運算符了,在下面的例子中,Math.max不能應用於arr
數組,因為它不將數組作為參數,但它可以將各個元素作為參數傳入。展開運算符...可用於提取數組的各個元素。constarr=[4,6,-1,3,10,4];
constmax=Math.max(...arr);
console.log(max);
//10
05、剩餘參數
剩餘參數語法和展開語法看起來的一樣的,不同的是展開語法是為了結構數組和對象;而剩餘參數和展開運算符是相反的,剩餘參數收集多個元素合成一個數組。functionmyFunc(...args){
console.log(args[0]+args[1]);
}
myFunc(1,2,3,4);
//3
restparameters和arguments的區別
1.arguments是偽數組,包含所有的實參
2.剩餘參數是標準的數組,可以使用數組的方法
06、數組方法
JavaScript數組方法通常可以提供令人難以置信的、優雅的方法來執行所需的數據轉換。作為StackOverflow
的貢獻者,我經常看到關於如何以某種方式操縱對象數組的問題,這往往也是數組方法的完美用例。
map、filter、rece
JavaScript數組方法map、filter和rece容易混淆,這些都是轉換數組或返回聚合值的有用方法。
map:返回一個數組,其中每個元素都使用指定函數進行過轉換。constarr=[1,2,3,4,5,6];
constmapped=arr.map(el=>el+20);
console.log(mapped);
//[21,22,23,24,25,26]
filter:返回一個數組,只有當指定函數返回true時,相應的元素才會被包含在這個數組中。constarr=[1,2,3,4,5,6];
constfiltered=arr.filter(el=>el===2||el===4);
console.log(filtered);
//[2,4]
rece:按函數中指定的值累加constarr=[1,2,3,4,5,6];
constreced=arr.rece((total,current)=>total+current);
console.log(reced);
//21
find,findIndex,indexOf
find:返回與指定條件匹配的第一個實例,如果查到不會繼續查找其他匹配的實例。constarr=[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10];
constfound=arr.find(el=>el>5);
console.log(found);
//6
再次注意,雖然5之後的所有元素都滿足條件,但是只返回第一個匹配的元素。當你發現匹配項時,通常會中斷for循環,在這種情況下,這實際上非常有用。
findIndex:這與find幾乎完全相同,但不是返回第一個匹配元素,而是返回第一個匹配元素的索引。constarr=['Nick','Frank','Joe','Frank'];
constfoundIndex=arr.findIndex(el=>el==='Frank');
console.log(foundIndex);
//1
indexOf:與findIndex幾乎完全相同,但它不是將函數作為參數,而是採用一個簡單的值。
當w你需要更簡單的邏輯並且不需要使用函數來檢查是否存在匹配時,可以使用此方法。
constarr=['Nick','Frank','Joe','Frank'];
constfoundIndex=arr.indexOf('Frank');
console.log(foundIndex);
//1
push,pop,shift,unshift
push:這是一個相對簡單的方法,它將一個項添加到數組的末尾。它就地修改數組,函數本身會返回添加到數組中的項。
letarr=[1,2,3,4];
constpushed=arr.push(5);
console.log(arr);
//[1,2,3,4,5]
console.log(pushed);
//5
pop:這將從數組中刪除最後一項。同樣,它在適當的位置修改數組,函數本身返回從數組中刪除的項。
letarr=[1,2,3,4];
constpopped=arr.pop();
console.log(arr);
//[1,2,3]
console.log(popped);
//4
shift:從數組中刪除第一項。同樣,它在適當的位置修改數組。函數本身返回從數組中刪除的項。
letarr=[1,2,3,4];
constshifted=arr.shift();
console.log(arr);
//[2,3,4]
console.log(shifted);
//1
unshift:將一個或多個元素添加到數組的開頭。同樣,它在適當的位置修改數組。與許多其他方法不同,函數本身返回數組的新長度。
letarr=[1,2,3,4];
constunshifted=arr.unshift(5,6,7);
console.log(arr);
//[5,6,7,1,2,3,4]
console.log(unshifted);
//7
splice,slice
splice:通過刪除或替換現有元素和/或添加新元素來更改數組的內容,此方法會修改了數組本身。
下面的代碼示例的意思是:在數組的位置1上刪除0個元素,並插入b。
letarr=['a','c','d','e'];
arr.splice(1,0,'b')
slice:從指定的起始位置和指定的結束位置之前返回數組的淺拷貝。如果未指定結束位置,則返回數組的其餘部分。
重要的是,此方法不會修改數組,而是返回所需的子集。
letarr=['a','b','c','d','e'];
constsliced=arr.slice(2,4);
console.log(sliced);
//['c','d']
console.log(arr);
//['a','b','c','d','e']
sort
sort:根據提供的函數對數組進行排序。這個方法就地修改數組。如果函數返回負數或0,則順序保持不變。如果返回正數,則交換元素順序。
letarr=[1,7,3,-1,5,7,2];
constsorter=(firstEl,secondEl)=>firstEl-secondEl;
arr.sort(sorter);
console.log(arr);
//[-1,1,2,3,5,7,7]
07、Generators(生成器)
生成器是一種特殊的行為,實際上是一種設計模式,我們通過調用next()方法來遍歷一組有序的值。想像一下,例如使用遍歷器對數組[1,2,3,4,5]進行遍歷。第一次調用next()方法返回1,第二次調用next()方法返回2,以此類推。當數組中的所有值都返回後,調用next()方法將返回null或false或其它可能的值用來表示數組中的所有元素都已遍歷完畢。
function*greeter(){
yield'Hi'
yield'Howareyou?'
yield'Bye'
}
constgreet=greeter();
console.log(greet.next().value);
//'Hi'
console.log(greet.next().value);
//'Howareyou?'
console.log(greet.next().value);
//'Bye'
console.log(greet.next().value);
//undefined
使用生成器生成無限個值:
function*idCreator(){
leti=0;
while(true)
yieldi++;
}
constids=idCreator();
console.log(ids.next().value);
//0
console.log(ids.next().value);
//1
console.log(ids.next().value);
//2
//etc...
08、恆等運算符(===)與相等運算符(==)
大家一定要知道JavaScript中的恆等運算符(===)和相等運算符(==)之間的區別!
==運算符在比較值之前會進行類型轉換,而===運算符在比較之前不會進行任何類型轉換。
console.log(0==Ɔ');
//true
console.log(0===Ɔ');
//false
09、對象比較
我看到JavaScript新手所犯的錯誤是直接比較對象。變數指向內存中對象的引用,而不是對象本身!實際比較它們的一種方法是將對象轉換為JSON
字元串。這有一個缺點:對象屬性順序不能保證!比較對象的一種更安全的方法是引入專門進行深度對象比較的庫(例如,lodash的isEqual)。
下面的對象看起來是相等的,但實際上它們指向不同的引用。
constjoe1={name:'Joe'};
constjoe2={name:'Joe'};
console.log(joe1===joe2);
//false
相反,下面的計算結果為true,因為一個對象被設置為與另一個對象相等,因此指向相同的引用(內存中只有一個對象)。
constjoe1={name:'Joe'};
constjoe2=joe1;
console.log(joe1===joe2);
//true
相反,以下計算結果為true,因為一個對象設置為等於另一個對象,因此指向相同的引用(內存中只有一個對象)。
constjoe1={name:'Joe'};
constjoe2=joe1;
console.log(joe1===joe2);
//true
10、回調函數
很多人都被JavaScript回調函數嚇倒了!他們很簡單,舉個例子。console.log函數作為回調傳遞給myFunc。
它在setTimeout完成時執行。
functionmyFunc(text,callback){
setTimeout(function(){
callback(text);
},2000);
}
myFunc('Helloworld!',console.log);
//'Helloworld!'
11、Promises
一旦你理解了JavaScript回調,很快就會發現自己陷入了「回調地獄」中。這個時候可以使用promise,將非同步邏輯包裝在promise
中,成功時resolve或在失敗時reject使用「then」來處理成功的情況,使用catch來處理異常。
constmyPromise=newPromise(function(res,rej){
setTimeout(function(){
if(Math.random()<0.9){
returnres('Hooray!');
}
returnrej('Ohno!');
},1000);
});
myPromise
.then(function(data){
console.log('Success:'+data);
})
.catch(function(err){
console.log('Error:'+err);
});
//IfMath.random()returnslessthan0.9thefollowingislogged:
//"Success:Hooray!"
//IfMath.random()returns0.:
//"Error:Onno!"
12、Async/Await
在掌握了promise的用法後,你可能也會喜歡asyncawait,它只是一種基於promise
的「語法糖」。在下面的示例中,我們創建了一個async函數,並awaitgreeterpromise。
constgreeter=newPromise((res,rej)=>{
setTimeout(()=>res('Helloworld!'),2000);
})
asyncfuncti
F. JQuery的post提交方式為什麼要序列化,而Get提交方式就不用序列化做了什麼
這是因為後台能夠直接處理的數據格式,是一種經過序列化的鍵值對數據,比如前端要向後台提交三個參數,分別是a=1,b=2,c=3,那麼後台接收到的數據就應該是a=1&b=2&c=3(可以看到其實就是每個「鍵值對」之間用&連接)。當我們用get方式提交數據時,參數是直接附加到url後面的,即
xxx.xxx這是域名此略.xxx?a=1&b=2&c=3
可以看到?後面的正是後台程序能夠直接處理的數據格式,所以get方式提交數據的話,就不需要再對參數進行序列化處理了,直接提交即可。
而當我們用post方式提交時,通常我們提交的數據本身就是一個json對象,比如說像這樣的:
var data = {a:1, b:2, c:3};
而提交時數據是直接以原始格式存儲在body中而不是以鍵值對的方式附加到url中的,所以後台程序是無法直接識別的,這時候就需要在提交前先把data轉換為 a=1&b=2&c=3 的格式再提交,這就是序列化。
當然,如果數據是通過表單提交的,那麼不管是post方式還是get,瀏覽器會自動進行序列化,無需前端js再做任何處理。
G. jquery或js前端提交數據的幾種方式
1.jquery提交數據的方式:
(1)第一種jquery序列化提交數據方式:
通過id獲取的form表單元素.serialize();
(2)第二種模擬form表單提交元素:
$('#form表單id').attr('method','post');
$('#form表單id'').find('input[name="type"]').val(test);
$('#form表單id').find('input[name="dfrom_to1"]').val(dfrom_to);
$('#form表單id').find('input[name="gt_road_new"]').val(gt_road);
$('#form表id').attr('action',AdminLTE.ctx+'/moles/ltegt/findAllCoverAndInterfere.do');
$('#analysisForm').submit();
2.js提交數據的方式:
(1).js提交表單( .submit()方法提交表單 )
function doSearch(){
var action ="<%=path%>/User_queryAllUser";
document.all.form.action = action;
document.all.form.submit();}
(2).js替代超鏈接( window.location.href )
<input type="button" id="modify" value="修改工號" οnclick="modifyEmp(${ myList.employeeId })">
//js不能起名為modify,為敏感關鍵字
function modifyEmp( employeeId ){
//employeeId 作為js的參數傳遞進來
window.location.href = '<%=path%>/User_openUserUpdate?employeeId='+employeeId;
H. 利用PCR技術的前提是要有一段已知目的基因的核苷酸序列,一端已知目的基因的核苷酸序列是什麼意思
DNA的合成前端必須是有一小段序列,接著這段序列合成,而不能憑空合成。它前面這一小段序列就是你所要有設計的引物,也就是「一段已知目的基因的核苷酸序列」.需要根據你的模板鏈設計。因此,擴增不同的基因需要設計不同的引物。
I. 建設銀行前端序列錯誤
瀏覽器設置問題,您重設置一下瀏覽器試試看,(點擊IE瀏覽器的"工具菜單"-internet選項-高級選項卡-重置按鍵,重置完成後重啟瀏覽器。
瀏覽器安全設置級別較高,插件被攔截了,您交易過程中注意瀏覽器上方或下方有沒有彈出阻止載入項之類的,如果有您點擊載入或在所有網站運行即可。
在出現問題的界面點擊瀏覽器的「工具菜單」-「兼容性視圖設置」;在彈出的窗口中點擊「添加」按鍵,此時會把建行的網站添加進去,添加完成後點擊「關閉」按鍵,然後刷新網頁再重新登陸即可。
程序錯誤是指在軟體運行中因為程序本身有錯誤而造成的功能不正常、死機、數據丟失、非正常中斷等現象。系統程序錯誤是指系統程序本身有錯誤而造成的功能不正常、死機或中斷等現象。有些系統程序錯誤會造成計算機安全隱患,此時叫做系統漏洞。
J. PCR引物是什麼
聚合酶鏈式反應簡稱PCR(Polymerase Chain Reaction) (又稱:多聚酶鏈式反應) PCR是體外酶促合成特異DNA片段的一種方法,由高溫變性、低溫退火(復性)及適溫延伸等反應組成一個周期,循環進行,使目的DNA得以迅速擴增,具有特異性強、靈敏度高、操作簡便、省時等特點。
它不僅可用於基因分離、克隆和核酸序列分析等基礎研究,還可用於疾病的診斷或任何有DNA,RNA的地方。PCR又稱無細胞分子克隆或特異性DNA序列體外引物定向酶促擴增技術。
(10)前端序列合成擴展閱讀:
PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:
模板DNA的變性
模板DNA經加 熱至93℃左右一定時間後,使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;
模板DNA與引 物的退火(復性)
模板DNA經加熱變性成單鏈後,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;
引物的延伸
DNA模板--引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按鹼基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈,重復循環變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的「半保留復制鏈」,而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。
每完成一個循環需 2~4分鍾,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。到達平台期(Plateau)所需循環次數取決於樣品中模板的拷貝。
參考資料來源:
網路-PCR擴增