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ftp怎麼下載本地blast

發布時間: 2022-09-13 03:53:08

① 兩台電腦怎麼通過ftp下載文件

在兩台計算機之間傳輸數據吧,如果只是傳數據,使用共享文件夾就可以!
方法如下:1。在我的電腦D盤,建立一個文件夾D:/share2。在share文件夾上點右鍵,選擇共享,找到「網路共享和安全」,勾選「在網路上共享這個文件夾」項3。查看下本機的IP(如:192.168.1.23)或是計算機名(pc1),4。在另一台計算機上,當然得保證在同一網段,打開我的電腦,在地址欄輸入開啟共享機的IP地地址如:\\192.168.1.23,如果共享成功,就可以看到share文件夾,就可以相互傳文件了

另外如果使用FTP的話,其實不能叫傳文件,這個方法實際是建立一個FTP伺服器,然後讓客戶機去訪問FTP伺服器,從FTP上下載文件到本地計算機,當然這個的目的,也是為了實現文件交換。方法如下:1。上網下載FTP伺服器軟體,如cuteFTP或是HomeFTP(推薦,主要是配置簡單易用),或是直接在操作系統上安裝IIS伺服器(這個只能是windows系統)然後應用IIS的FTP功能也可以實現FTP,當然也可以用其它的FTP伺服器;這里以HOMEFTPServer為例講解2。安裝下載好的HOMEFTP伺服器,安裝好之後進行配置
1點擊設置,可以配置匿名用戶,指定目錄,即FTP文件伺服器目錄(如:D:\FTPRoot),也可以配置虛擬目錄,配置後可以將其它盤(F:\share)的目錄虛擬到FTPRoot下,而可以獲得FTPRoot的許可權;這個伺服器就這點最精典
2點擊新增成員,可以添加新用戶,即非匿名用戶,可以配置許可權和虛擬目錄;
3配置好之後點擊開始服務啟動FTP伺服器
4查看伺服器(裝有FTP軟體的計算機)的IP地址如:192.168.1.233。在客戶機,打開我的電腦,在地址欄輸入ftp://192.168.1.23如果配置成功,即可以訪問FTP伺服器,如果開啟文件上傳許可權,可以上傳或下載文件
當然也可以下載一個FTP伺服器客戶端工具,即可以訪問
注意:如果沒安裝FTP客戶端,使用非匿名用戶訪問時要用到帳號和密碼,格式為:ftp://用戶:密碼@伺服器IP如:ftp://admin:[email protected]登陸後,獲得admin用戶的所有許可權

② ftp中的文件怎麼下載

用瀏覽器,打開FTP伺服器後,登錄,只要當前的帳號有列表和下載的許可權,就能看到文件,在文件上直接拖放到本地,即可下載。

或者在文件上右鍵,選擇目標另存為,也可以下載並保存到當前電腦中。

③ 如何使BLAST程序在windows計算機上本地化

Blast本地化詳細攻略(基於Windows系統)by Fredy 2010-12-16 17:40 | (分類:默認分
類)
最近終於把Blast本地化弄明白了,參照網上的攻略稍微整理了一下,希望能給學生物的朋友帶來一些方便,畢竟好的生物信息學分析是成功的一半嘛~~ 1. 從NCBI上下載Blast本地化程序,下載地址:
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/release/2.2.9/blast-2.2.9-ia32-win32.exe 安裝得到的Blast本地化軟體安裝包,安裝路徑例如"C:\Blast\bin\"。
2. 從相關生物信息學網站上下載資料庫,如NCBI的nt庫,DFCI的相關EST資料庫或者是用戶自己建立的fasta格式的核酸序列文件等,將資料庫文件移動至Blast本地化程序目錄「C:\Blast\bin」
3. 用文本編輯器(txt文件改名字及後綴)創建一個ncbi.ini文件,文件包含下面內容: [NCBI]Data="C:\blast\data\"
將ncbi.ini文件存放到系統的Windows 或者 WINNT目錄。
4. 將Blast本地化程序目錄添加路徑中(該步驟非必須,但會給以後的操作帶來方便),方法:
a)右擊我的電腦選擇屬性,選擇高級,點擊環境變數,設置環境變數
b)系統變數中,選擇Path,點擊「編輯」,在變數值的後面添加Blast本地化程序所在路徑,如「C:\Blast\bin」,點擊確定,將安裝路徑添加到path。
5. 測試,打開dos窗口(點擊開始,選擇運行,打開的輸入框中輸入"cmd」,確定),鍵入"blastall」,回車,如果安裝正確,將顯示blastall的所有參數說明。如果之前沒有進行步驟4,則訪問Blast本地化程序所在文件夾後輸入"blastall"進行測試。
【訪問文件夾時可能用到dos命令有盤符切換"X:"及路徑切換"cd \blast\bin」】
6. 下載得到的資料庫為fasta格式,需要經過格式轉化後才能進行blast,打開dos窗口,訪問Blast本地化程序所在文件夾,輸入格式化資料庫命令: formatdb.exe -i nt.fas -p F -o F
命令中nt.fasta可換為其他預進行格式化的原始fasta資料庫文件,稍等片刻,電腦完成資料庫的格式化,會在在原資料庫文件所在文件夾生成一系列文件,格式化過程無系統報錯,Blast本地化體系即構建完成。
7. Blast本地化:在Blast本地化程序所在文件夾創建test.txt文件,將需要Blast的序列以fasta格式存於該文件中,打開dos窗口,訪問Blast本地化程序所在文件夾,輸入Blastn命令:
blastall -p blastn -d nt.fas -i test.txt -o out.txt

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稍等片刻,Blast結果即存於系統自動生成的out.txt文件中。
此外就是建議將常用命令保存在一個txt文件中,需要時直接在dos裡面用滑鼠右鍵粘貼就ok了。在test.txt中以fasta格式存儲多個序列可以一次得到比對多個序列的結果。

④ 怎麼利用ftp把資料下載到本地電腦

請確認你在訪問那個FTP時是不是有讀取許可權。也就是下載許可權。如果沒有許可權就會出現你說的那種情況。
如果有許可權的話直接用滑鼠選中你要下載的文件或目錄右鍵單擊,選中復制,然後選擇你要存放的路徑,點確定即可,當然,也可以用樓上說的方法,找個FTP客戶端FLASHFTP,也可以用迅雷的FTP資源探測器。選擇新建,把FTP信息填寫一下就可以了。~~

⑤ 怎麼從從ncbi的ftp上下了windows的本地blast

可以四個一起。網頁上有說明「owertextbox..,.Reformattheresultsandcheck'CDSfeature'todisplaythatannotation.」也就是說在上下的輸入位置,可以同時輸入一個以上的序列。如果上下同時輸入2個,就是4個序列了。

⑥ 怎麼從FTP上下載東西

其實我建議使用一個專門的ftp客戶端來使用ftp比較好,這樣你只需要在客戶端上輸入ftp伺服器的IP和埠,賬號,密碼,就能輕松的上傳和下載文件,非常實用。

這里我推薦使用IIS7伺服器管理工具,它可以作為FTP的客戶端,想要進行FTP的上傳下載操作,只需要下載安裝iis7伺服器管理工具就可以了!免費下載,很方便。

同時它還可以作為VNC的客戶端,進行VNC的相應操作!它能夠連接Windows和Linux系統下的伺服器和VPS,能滿足你不同系統的使用,感覺不錯的話可以試試

⑦ 如何使用get命令利用FTP下載文件到本地

1、從遠程ftp伺服器下載文件的命令格式:
get 遠程ftp伺服器上當前目錄下要下載的文件名。
2、附上ftp常用命令,如下所示:
FTP>open [ftpservername],和指定的遠程Linux FTP伺服器連接。
FTP>user [username] [password],使用指定遠程Linux FTP伺服器的用戶登錄。
FTP>pwd,顯示遠程Linux FTP伺服器上的當前路徑。
FTP>ls,列出遠程Linux FTP伺服器上當前路徑下的目錄和文件。
FTP>dir,列出遠程Linux FTP伺服器上當前路徑下的目錄和文件(同上)。
FTP>mkdir [foldname],在遠程Linux FTP伺服器上當前路徑下建立指定目錄。
FTP>rmdir [foldname],刪除遠程Linux FTP伺服器上當前路徑下的指定目錄。
FTP>cd [foldname],更改遠程Linux FTP伺服器上的工作目錄。
FTP>delete [filename],刪除遠程Linux FTP伺服器上指定的文件。
FTP>rename [filename] [newfilename],重命名遠程Linux FTP伺服器上指定的文件。
FTP>close,從遠程Linux FTP伺服器斷開但保留FTP命令參數提示。
FTP>disconnect,從遠程Linux FTP伺服器斷開但保留FTP命令參數提示(同上)。
FTP>bye,結束和遠程Linux FTP伺服器的連接。
FTP>quit,結束和遠程Linux FTP伺服器的連接(同上)。
FTP>!,直接從遠程Linux FTP伺服器進入到本地shell中。
FTP>exit,(接上步)從本地shell環境中返回到遠程Linux FTP伺服器環境下。
FTP>!ls,列出本地機器上當前路徑下的目錄和文件。
FTP>lcd [foldname],更改本地機器的工作目錄。

⑧ 怎麼從從ncbi的ftp上下了windows的本地blast

This document describes the "BLAST" databases available on the NCBI
FTP site under the /blast/db directory. The direct URL is:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db 本地BLAST資料庫下載地址

⑨ 怎麼從從ncbi的ftp上下了windows的本地blast

This document describes the "BLAST" databases available on the NCBI
FTP site under the /blast/db directory. The direct URL is:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db 本地BLAST資料庫下載地址
1. General Introction
NCBI BLAST home pages (http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/) use a standard
set of BLAST databases for Nucleotide, Protein, and Translated BLAST
searches. These databases are made available in the /blast/db directory as
compressed archives (ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/) in pre-formatted
format.這些資料庫是已經預先進行過makeblastdb命令的,下載後可以直接使用
The FASTA databases reside under the /blast/db/FASTA directory.
The pre-formatted databases offer the following advantages:
* The pre-formatted databases are smaller in size and therefore are
faster to download;
* Sequences in FASTA format can be generated from the pre-formatted
databases by the fastacmd utility; 可以從這些資料庫文件中導出FASTA文件
* A convenient script (update_blastdb.pl) is available to download
the pre-formatted databases from the NCBI ftp site; 可用該腳本升級資料庫
* Pre-formatting removes the need to run formatdb; 無需再運行建庫命令行
* Taxonomy ids are available for each database entry.
Pre-formatted databases must be downloaded using the update_blastdb.pl
script or via FTP in binary mode. Documentation for the update_blastdb.pl
script can be obtained by running the script without any arguments (perl is
required). 下載資料庫時,需要用到perl腳本update_blastdb.pl,或使用FTP下載工具
The compressed files downloaded must be inflated with gzip or other decompress
tools. The BLAST database files can then be extracted out of the resulting
tar file using tar program on Unix/Linux or WinZip and StuffIt Expander
on Windows and Macintosh platforms, respectively.下載的資料庫為壓縮包,要解壓縮
Large databases are formatted in multiple 1 Gigabytes volumes, which
are named using the database.##.tar.gz convention. All relevant volumes
are required. An alias file is provided so that the database can be called
using the alias name without the extension (.nal or .pal). For example,
to call est database, simply use "-d est" option in the commandline
(without the quotes). 大的資料庫通常分為多個壓縮包,例如nr庫有11個壓縮包。所有的相關壓縮包
都要下載,解壓。解壓縮會生成對應的庫文件,同時生成一個nr.pal文件。檢索nr庫時輸入-d nr 即可。
Certain databases are subsets of a larger parental database. For those
databases, alias and mask files, rather than actual databases, are provided.
The mask file needs the parent database to function properly. The parent
databases should be generated on the same day as the mask file. For
example, to use swissprot pre-formatted database, swissprot.tar.gz, one
will need to get the nr.tar.gz with the same date stamp. 有些資料庫是大資料庫
的子集,使用這些子集資料庫時,必須同時下載其(相同日期的)大資料庫
Additional BLAST databases that are not provided in pre-formatted
formats are available in the FASTA subdirectory. 有些BLAST資料庫沒有提供預先建庫
的文件,這些資料庫可以從FASTA文件夾里下載 For genomic BLAST
databases, please check the genomes ftp directory at:
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/ 在這里下載基因組BLAST資料庫

2. Contents of the /blast/db/ directory
The pre-formatted BLAST databases are archived in this directory. The
name of these databases and their contents are listed below.
資料庫名稱 資料庫內容
+----------------------+-----------------------------------------------+
|File Name | Content Description |
+----------------------+-----------------------------------------------+
/FASTA | subdirectory for FASTA formatted sequences
存放FASTA格式序列的子文件夾

README | README for this subdirectory (this file)
env_nr.*tar.gz | Environmental protein sequences 環境蛋白序列
env_nt.*tar.gz | Environmental nucleotide sequences 環境核苷酸序列
est.*tar.gz | volumes of the formatted est database
| from the EST division of GenBank, EMBL,
| and DDBJ. EST資料庫