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基因組學資料庫

發布時間: 2022-05-12 15:22:12

㈠ 康黎醫學是否有針對中國人群的抑鬱症用葯基因資料庫

有的,康黎醫學自建針對中國人群的抑鬱症用葯基因資料庫,研發的葯物基因組學項目對臨床用葯方案的指導具有重大意義。通過基因檢測,可整體評估患者葯物基因情況,包括葯物代謝、毒性、應答等,給予臨床醫生真實的基因數據和可靠的用葯選擇,從而達到精準治療的目的。
在2019年4月的第十五屆精神科醫師年會上,湖北省人民醫院主任醫師劉忠純教授在主題為「精準醫療在精神疾病領域的應用」的演講,演講中特意強調了康黎醫學建立的針對中國人群的精神疾病用葯相關基因變異位點臨床資料庫,為精神疾病臨床提供精確的遺傳數據、專業分析方案,並展望了開展基於中國人群的臨床應用研究及基於AI的治療策略。從劉教授的肯定可以看出康黎醫學自建針對中國人的抑鬱症用葯基因資料庫對於中國抑鬱症治療發展的重要性。

㈡ 基因組資料庫的GDB資料庫

由美國Johns Hopkins大學於1990年建立的GDB是重要的人類基因組資料庫,由加拿大兒童醫院生物信息中心負責管理。
GDB資料庫用表格方式給出基因組結構數據,包括基因單位、PCR位點、細胞遺傳標記、EST、疊連群(Contig)、重復片段等;並可顯示基因組圖譜,其中包括細胞遺傳圖、連鎖圖、放射雜交圖、疊連群圖、轉錄圖等;並給出等位基因等基因多態性資料庫。此外,GDB資料庫還包括了與核酸序列資料庫GenBank和EMBL、遺傳疾病資料庫OMIM、文獻摘要資料庫MedLine等其它網路信息資源的超文本鏈接。
GDB資料庫是用大型商業軟體Sybase資料庫管理系統開發的,並用Java語言編寫基因圖譜顯示程序,為用戶提供了很好的界面,缺點是傳輸速度受到一定限制。
GDB資料庫是國際合作的成果,其宗旨是為從事基因組研究的生物學家和醫護人員提供人類基因組信息資源。其數據來自於世界各國基因組研究的成果,經過注冊的用戶可以直接向GDB資料庫中添加和編輯數據。

㈢ 基因組學與應用生物學是核心期刊嗎

《基因組學與應用生物學》是中國四大期刊資料庫之核心期刊:
中國科技期刊全文資料庫(清華大學知網資料庫)
《中文核心期刊要目總覽》核心期刊(北京大學圖書館,2011年版,即第六版)
中國科學引文資料庫(CSCD)來源期刊(中國科學院文獻情報中心)
中國科技論文統計源期刊(中國科技核心期刊,中國科學技術信息研究所)

㈣ 核酸序列資料庫和基因組資料庫的區別

核酸序列資料庫(genbank)和基因組資料庫(ensemble)的區別:
1、GenBank
是一個有來自於70,000多種生物的核苷酸序列的資料庫。每條紀錄都有編碼區(CDS)特徵的注釋,還包括氨基酸的翻譯。GenBank屬於一個序列資料庫的國際合作組織,包括EMBL和DDBJ。
2、Ensemble資料庫可為葯物研發提供超過167,000種生物活性化合物包括化學結構在內的必要信息。本資料庫利用用戶容易掌握的界面將數據、文本和圖象資料有機地結合起來,便於查詢。Ensemble可從葯品專利開始,再通過其臨床前和臨床研究資料,直至注冊信息、市場概況及其他方面的相關資料來跟蹤葯物。資料庫每月更新一次,每年增加約10,000
種新化合物。

㈤ DNA資料庫的EMBL

歐洲生物信息學研究所(European
Bioinformatics
Institute,
EBI)創建的一個核酸序列資料庫。EMBL的數據來源主要有兩部分,一部分由科研人員或某些基因組測序機構通過計算機網路直接提交,另一部分則來自科技文獻或專利(Stoesser等,
1998)。EMBL與DDBJ、GenBank建有合作關系,他們分別在全世界范圍內收集核酸序列信息,每天都將新發現或更新過的數據相互交換。
DNA資料庫的規模正在以指數方式增長,平均不到9個月就增加一倍。1998年1月,EMBL中收錄的序列數已超過一百萬,包括15,500個物種,其中模式生物的序列佔50%以上,它們包括人類(Homo
sapiens),
線蟲(Caenorhabditis
elegans),啤酒酵母(Saccharomyces
cerevisiae),小鼠(Mus
musculus)和擬南芥(Arabidopsis
thalania)。
可以利用序列查詢系統
SRS(Sequence
Retrieval
System)從EMBL資料庫中提取有關信息(Etzold等,1996年)。SRS序列查詢系統通過超文本鏈接將DNA序列資料庫和蛋白質序列、功能位點、結構、基因圖譜以及文獻摘要MEDLINE等各種資料庫聯系在一起。利用EBI網站提供的BLAST或FastA程序,可以對EMBL資料庫進行未知序列同源性搜索。

㈥ 人的基因資料庫和指紋資料庫有哪些不同

人類手指上的皮膚和身體的皮膚有很大不同。其一,手指皮膚有凸紋,沒有毛發,不會有油脂,但卻有很多汗孔;其二,指紋具有唯一性和穩定性,隨著年齡的增長指紋上雖然會起皺,但是圖案基本不變;其三,人手接觸各種物體表面通常會留下痕跡。這些特性就使得指紋特別適合做身份識別,也即我們所說的「指紋識別」。

美國夏威夷大學癌症研究中心研究發現:女性左手指箕形紋如果開口向右的紋形較多,患乳癌的機會可能較高。英國學者的研究證實:斗紋越多,越容易患高血壓。美國紐約大學的研究發現:老年痴呆病人組中,十指中有8個指頭為小指側箕型的人佔72%,而對照組中只有26%;病人組中有14人的十指全部為小指側箕型指紋,而對照組中只有4人。專家同時說,這僅是統計學的調查資料,並不意味著凡是十指中有8個指頭是小指側箕型紋的人,都一定會患上老年性痴呆症。

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㈧ 已有基因序列,怎麼在NCBI里獲得基因登錄號

填寫上傳的序列相關信息。Continue,進入Sequence Technology界面,繼續填寫基礎信息,以我上傳的序列轉錄組測序結果為例,illumina 二代測序技術,填完continue即可。

單位簡介

國家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information) 是美國國家醫學圖書館(NLM)的一部分(該圖書館是美國國家衛生研究所的一部分)。

許多受尊敬的研究者在NCBI工作, 如比較基因組學領域的一位多產的科學家Eugene Koonin和BLAST序列資料庫搜索演算法的作者Stephen Altschul。

㈨ 如何在網上找尋模式生物的基因組數據

玉米基因組在Science雜志中可以查找到。
去年年初,美國科學家成功測序得出了玉米基因組的草圖,這是由測序項目負責人——聖路易斯華盛頓大學基因組測序中心主任理查德·威爾遜在「玉米遺傳學會議」第50次年會上公布的。科學家們以代號為B73的高產玉米品種為研究對象,完成了約95%的基因組測序工作。結果顯示,玉米基因組的基因數量為5萬至6萬個,鹼基對數量大約為20億個。
基因組,一個細胞或者生物體所攜帶的一套完整的單倍體序列,包括全套基因和間隔序列。可是基因組測序的結果發現基因編碼序列只佔整個基因組序列的很小一部分。因此,基因組應該指單倍體細胞中包括編碼序列和非編碼序列在內的全部DNA分子。說的更確切些,核基因組是單倍體細胞核內的全部 DNA分子;線粒體基因組則是一個線粒體所包含的全部DNA分子;葉綠體基因組則是一個葉綠體所包含的全部DNA分子。中國研究人員成功破譯高山倭蛙基因組 迄今為止破譯的首個現代蛙類基因組。