① 生物催化和生物降解的資料庫及網址有哪些
生物催化和生物降解的資料庫及網址有哪些
生物降解作用
生物降解是引起有機污染物分解的最重要的環境過程之一.水環境中化合物的生物降解依賴於微生物通過酶催化反應分解有機物.當微生物代謝時,一些有機污染物作為食物源提供能量和提供細胞生長所需的碳；另一些有機物,不能作為微生物的唯一碳源和能源,必須由另外的化合物提供.因此,有機物生物降解存在兩種代謝模式：生長代謝(Growth metabolism)和共代謝(Cometabolism).這兩種代謝特徵和降解速率極不相同,下面分別進行討論.
1．生長代謝
許多有毒物質可以像天然有機化合物那樣作為微生物的生長基質.只要用這些有毒物質作為微生物培養的唯一碳源便可鑒定是否屬生長代謝.在生長代謝過程中微生物可對有毒物質進行較徹底的降解或礦化,因而是解毒生長基質去毒效應和相當快的生長基質代謝意味著與那些不能用這種方法降解的化合物相比,對環境威脅小.
一個化合物在開始使用之前,必須使微生物群落適應這種化學物質,在野外和室內試驗表明,一般需要2—50天的滯後期,一旦微生物群體適應了它,生長基質的降解是相當快的.由於生長基質和生長濃度均隨時間而變化,因而其動力學表達式相當復雜.Monod方程是用來描述當化合物作為唯一碳源時,化合物的降解速率：
式中：c——污染物濃度；
B——細菌濃度；
Y——消耗一個單位碳所產生的生物量；
μmax——最大的比生長速率；
Ks——半飽和常數,即在最大比生長速率μmax一半時的基質濃度.
Monod方程式在實驗中已成功地應用於唯一碳源的基質轉化速率,而不論細菌菌株是單一種還是天然的混合的種群.Paris等用不同來源的菌株,以馬拉硫磷作唯一碳源進行生物降解(如圖3—34所示).分析菌株生長的情況和馬拉硫磷的轉化速率,可以得到Monod方程中的各種參數：μmax =0.37h－1,Ks=2.17μmol／L(0.716mg／L),Y=4.1×1010cell／μmol(1.2 ×1011cell／mg)
Monod方程是非線性的,但是在污染物濃度很低時,即Ks>>c,則式可簡化為：
－dc／dt=Kb2·B·c』
式中：Kb2——二級生物降解速率常數.
② 美國國家標准與技術研究院的資料庫
根據標准參考數據計劃，NIST的各實驗室正在將他們的資料庫產品不斷加入到在線訪問的資料庫行列，建立了一系列的科學數值資料庫。通過更新現有的資料庫及開發新資料庫，NIST不斷地豐富它的評價數值數據集，為社會提供可靠的、經過評價的數值數據。社會各界的工程師和科學家依靠 NIST的標准參考數據對許多關鍵技術進行決策。
NIST的標准參考資料庫系列包括50多個資料庫，其中大部分是建在微機上的多用途數據包，根據學科可分為以下幾類：分析化學（包括譜學），原子和分子物理，生物技術，化學與晶體結構，化學動力學，工業流體與化工，材料性能，熱力學與熱化學，以及NIST的其它資料庫。
分析化學類包括質譜庫、紅外譜、光電子能譜等資料庫；原子與分子物理類包括光譜性能、c-射線衰減系數及交叉截面、原子光譜等資料庫；生物技術類包括生物大分子結晶庫等資料庫；化學與晶體結構類有電子衍射等資料庫；化學動力學類包括化學動力學、溶液動力學等資料庫；工業流體與化工類有物質的熱力學性能資料庫；材料性能類包括結構陶瓷、腐蝕性能、摩擦材料、高溫超導等資料庫；表面數據類包括表面結構、彈性電子散射交叉截面等資料庫；熱化學類包括化學熱力學、有機化合物熱力學性能估算、JANAF熱化學表等資料庫。
NIST提供科學數值數據服務的方式主要有：①將數據與分析儀器連在一起出售，如質譜庫中有近10萬個化合物數據，附在質譜儀中出售的有常用的幾萬個化合物；②以PC數據包方式出售；③聯機數據服務；④作為其它大的軟體包的一部分；⑤直接裝入用戶的計算機。
具體的在線科學資料庫名單如下：
兒童人體測量資料庫（AnthroKids - Anthropometric Data of Children），
鉑/氖陰極管燈泡的光譜圖（Atlas of the Spectrum of a Platinum/Neon Hollow-Cathode Lamp in the Region 1130-4330 Å），
用於電子結構計算的原子參考資料庫（Atomic Reference Data for Electronic Structure Calculations），
原子光譜資料庫（Atomic Spectra Database，ASD），
原子譜線加寬目錄資料庫（Atomic Spectral Line Broadening Bibliographic Database），
原子躍遷概率資料庫（Atomic Transition Probability Bibliographic Database），
原子重量及同位素成分資料庫（Atomic Weights and Isotopic Compositions），
光子總交叉截面（衰減系數）測量目錄（Bibliography of Photon Total Cross Section (Attenuation Coefficient) Measurements），
生物高分子結晶資料庫（Biological Macromolecule Crystallization Database），
陶瓷互聯網手冊（Ceramics WebBook），
化學動力學資料庫（CKMech，Chemical Kinetic Mechanisms），
化學互聯網手冊（Chemistry WebBook），
單分子反應計算資料庫（ChemRate: A Calculational Database for Unimolecular Reaction），
視覺協同測試床（CIS2 Visual Interoperability Testbed），
化學動力學機理（CKMech，Chemical Kinetic Mechanisms），
計算化學比較和基準資料庫（Computational Chemistry Comparison and Benchmark Database），
計算機辨認工具測試項目網站（Computer Forensics Tool Testing (CFTT) Project Web Site），
二階光譜資料庫（Diatomic Spectral Database），
運演算法則和數據結構字典（Dictionary of Algorithms and Data Structures），
電子與等離子體加工用氣體相互作用數據 (Electron Interactions with Plasma Processing Gases），
元素數據索引（Elemental Data Index），
工程統計學手冊（Engineering Statistics Handbook），
火災研究信息服務（Fire Research Information Services ，FRIS），
基本物理常數（Fundamental Physical Constants），
中性原子的基本水平和電離能量（Ground Levels and Ionization Energies for the Neutral Atoms），
數學軟體指南（Guide to Available Mathematical Software），
NIST計量結果不確定性的評估與表達指南（Guidelines for Evaluating and Expressing the Uncertainty of NIST Measurement Results），
基礎原子光譜數據手冊（Handbook of Basic Atomic Spectroscopic Data），
絕緣體和建築材料的熱傳遞性質（Heat Transmission Properties of Insulating and Building Materials），
高溫超導材料資料庫（High Temperature Superconcting Materials Database），
HIV蛋白酶資料庫（HIV Protease Database），
人線粒體蛋白資料庫（Human Mitochondrial Protein Database），
烴類光譜資料庫（Hydrocarbon Spectral Database），
二氧化碳同位素測定的交互規則（Interactive Algorithm for Isotopic CO2 Measurements），
國際比較資料庫（International Comparisions Database），
ITS-90熱電偶資料庫（ITS-90 Thermocouple Database），
自動數據分析工具（MassSpectator Automated Data Analysis Tool），
矩陣市場資料庫（Matrix Market Database），
相點陣圖和計算熱動力學―焊接系統（Phase Diagrams and Computational Thermodynamics - Solder Systems），
多輪烴結構索引（Polycyclic Aromatic Hydrocarbon Structure Index），
聚合物方法資料庫（Polymer MALDI MS Methods Database），
高級材料的性質數據總結（Property Data Summaries for Advanced Materials），
斷裂韌度性質數據總結（Property Data Summaries for Fracture Toughness），
氧化玻璃的性質數據總結（Property Data Summaries for Oxide Glasses），
蛋白質數據銀行（Protein Data Bank (PDB) ( in collaboration with RCSB )
放射性核半衰期計量（Radionuclide Half-Life Measurements），
用於觀測星際分子微波躍遷的雷達技術掃描頻率（Recommended Rest Frequencies for Observed Interstellar Molecular Microwave Transitions - 1991 Revision），
加強滲透性數值資料庫（Database on Reinforcement Permeability Values），
短暫前後重復的DNA資料庫（Short Tandem Repeat DNA Internet Database），
無鉛焊料的焊接特性資料庫（Database for Solder Properties with Emphasis on New Lead-free Solders），
可溶性資料庫（IUPAC-NIST Solubility Database），
溶解動力學資料庫（NDRL/NIST Solution Kinetics Database on the Web），
坎德拉X-射線天文台光譜資料庫（Spectral Data for the Chandra X-ray Observatory），
統計參考資料庫（Statistical Reference Datasets），
電子、質子和氦離子的靜止能與行程表（Stopping-Power and Range Tables for Electrons,Protons,and Helium Ions），
NIST結構陶瓷學資料庫（NIST Structural Ceramics Database），
合成聚合物質譜項目（Synthetic Polymer Mass Spectrometry Project），
X-射線質量衰減系數和能量吸收系數表（Tables of X-Ray Mass Attenuation Coefficients and Mass Energy - Absorption Coefficients），
酶催化反應的熱力學資料庫（Thermodynamics of Enzyme-Catalyzed Reactions Database），
半導體器件加工用的氣體的熱物理特性資料庫（Database of the Thermophysical Properties of Gases Used in the Semiconctor Instry），
三原子光譜資料庫（Triatomic Spectral Database），
Vibrational branching ratios and asymmetry parameters in the photoionization of CO2 in the region between 650 Å and 840 Å
可見物粘合劑數據集（NIST Visible Cement Dataset），
Wavenumber Calibration Tables from Heterodyne Frequency Measurements
用於劑量測定的X-射線衰減與吸收表（X-Ray Attenuation and Absorption for Materials of Dosimetric Interest），
X-射線波型系數、衰減與散射表（X-Ray Form Factor,Attenuation and Scattering Tables），
X-射線電光子分光光譜資料庫（NIST X-ray Photoelectron Spectros Database），
X-射線躍遷能量資料庫（X-Ray Transition Energies Database），
光子交叉截面資料庫（XCOM: Photon Cross Sections Database）。
③ 如何使用《NIST化學動力學資料庫》查找C+2H2=CH4；反應的反應速率常數公式
網址是http://kinetics.nist.gov/kinetics/index.jsp
C+2H2=CH4
沒有檢索到數據
Search returned 0 records.
④ NCBI是什麼主要是做什麼
NCBI (National Center for Biotechnology Information )是指美國國立生物技術信息中心。
理解自然無聲但精妙的關於生命細胞的語言是現代分子生物學的要求。通過只有四個字母來代表DNA化學亞基的字母表，出現了生命過程的語法，其最復雜形式就是人類。
闡明和使用這些字母來組成新的"單詞和短語"是分子生物學領域的中心焦點。數目巨大的分子數據和這些數據的隱秘而精細的模式使得計算機化的資料庫和分析方法成為絕對的必須。挑戰在於發現新的手段去處理這些數據的容量和復雜性，並且為研究人員提供更好的便利來獲得分析和計算的工具，以便推動對我們遺傳之物和其在健康和疾病中角色的理解。
基本研究
它的使命包括四項任務:
建立關於分子生物學，生物化學，和遺傳學知識的存儲和分析的自動系統。
實行關於用於分析生物學重要分子和復合物的結構和功能的基於計算機的信息處理的，先進方法的研究。
加速生物技術研究者和醫葯治療人員對資料庫和軟體的使用。
全世界范圍內的生物技術信息收集的合作努力。
NCBI通過下面的計劃來實現它的四項目的:
NCBI有一個多學科的研究小組包括計算機科學家，分子生物學家，數學家，生物化學家，實驗物理學家，和結構生物學家，集中於計算分子生物學的基本的和應用的研究。這些研究者不僅僅在基礎科學上做出重要貢獻，而且往往成為應用研究活動產生新方法的源泉。
他們一起用數學和計算的方法研究在分子水平上的基本的生物醫學問題。
這些問題包括基因的組織，序列的分析，和結構的預測。目前研究計劃的一些代表是:檢測和分析基因組織，重復序列形式，蛋白domain和結構單元，建立人類基因組的基因圖譜，HIV感染的動力學數學模型，資料庫搜索中的序列錯誤影響的分析，開發新的資料庫搜索和多重序列對齊演算法，建立非冗餘序列資料庫，序列相似性的統計顯著性評估的數學模型和文本檢索的矢量模型。
另外，NCBI研究者還堅持推動與NIH內部其他研究所及許多科學院和政府的研究實驗室的合作。
⑤ 葯融雲是葯物研發必備的資料庫嗎
葯融雲葯物研發必備資料庫
一、葯物研發
1、全球葯物研發資料庫
包含了全球已上市及處於不同研發階段的葯物詳細信息，包括葯物研發代碼、研發企業、適應症、治療領域、靶點、研發階段、工藝技術等信息，同時擴展葯物的研發狀態、關鍵性臨床以及銷售額信息。本資料庫可掌握全球在研新葯市場變化；了解全球新葯研發趨勢；解決立項、評估等問題；制定企業的戰略規劃。
(1)支持模糊檢索、精準檢索、條件篩選、組合檢索、熱點檢索、高級檢索（且、或、非）等檢索方式
(2)搜索結果包括葯品名稱、靶點信息、適應症、治療領域、工藝技術、專利號、原研企業、ATC信息、化學名稱、分子式、分子量、CAS號化學結構、上市時間軸，各個國家研發狀態、首批適應症、首次上市國家/地區、首次上市時間等。
(3)可視化圖表分析，利用可視化圖表分析可直觀了解，各個階段葯物詳情、靶點、適應症、治療領域等榜單。
葯理毒理資料庫