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癌症資料庫分析單個基因

發布時間: 2022-10-20 12:28:58

1. 癌症基因信息資料庫有什麼用

深圳市盛景基因醫療的癌症基因信息資料庫可以創建有統計意義的中國人中常見癌症變異與效果基線

2. 克隆到一個基因,該基因和癌症有關系,如何設計實驗證明它是原癌基因還是抑癌基因

大致有這樣的一個模式,你可以根據你的具體情況來選擇。
1.回答這個基因是否與癌症的病理等級/分型、臨床分期、臨床預後等參數有關?
a. 如果已有該基因產物的抗體:
i. 病理切片-->免疫組化-->免疫評分-->統計分析
ii. 新鮮臨床標本-->Western blot-->結果分析
b. 如果沒有相應抗體: 收集臨床新鮮腫瘤組織標本-->RT-PCR-->結果分析
回答了第一個問題,就可以大致推斷該基因可能是癌基因或者抑癌基因。當然做到這一步還遠不能證實你的問題。如果你是碩士的話,做到這一步是可以接受的。如果是博士的話,你就需要繼續回答下面的問題。
2. 該基因對某癌症的腫瘤生物學有如何影響?
對該基因進行上調或者下調,然後觀察下面的現象
體外實驗 (多選):
a. 該基因如何影響了腫瘤細胞的生長/存活/增殖?細胞生長曲線/MTT、WST-1 /BrdU摻入實驗 等等
b. 該基因如何影響了腫瘤細胞的細胞周期?細胞周期分析
c. 該基因如何影響了腫瘤細胞的凋亡?凋亡分析(TUNEL法、Annixin V/PI雙染法)
d. 該基因如何影響了腫瘤細胞的遷移? 如:細胞劃痕實驗
e. 該基因如何影響了腫瘤細胞的侵襲轉移? 如:Transwell 實驗
體內實驗:
裸鼠體內成瘤實驗!
觀察腫瘤生長速度(體積、腫瘤);血管密度
其他,如:腫瘤細胞增殖、凋亡等

回答了第二個問題,可以基本了解該基因影響了腫瘤生物學的哪個方面。
基本上可以夠博士畢業。

但是如果你要求比較高,還可以考慮回答第三個問題。
3. 該基因通過何種機制來影響腫瘤生物學的某個方面。
這個問題需要根據你第二個問題的結果具體來看。就不詳說了。
以上只是我個人的一些建議,希望能使你有個大致的輪廓印象。

3. 腺癌基因檢測結果,TP53檢查結果p.R65Qfs*84Exon4代表什麼

TP53基因又稱為P53,是一種抑癌基因,該基因編碼一種分子量為53kDa的蛋白質。在所有惡性腫瘤中,50%以上會出現該基因的突變,由這種基因編碼的蛋白質是一種轉錄因子,控制著細胞周期的啟動,從細胞分裂初始這個蛋白就起著決定性作用了。如果這個細胞受損,又不能得到修復,則P53蛋白將參與啟動過程,使這個細胞在細胞凋亡中死去。有TP53缺陷的細胞沒有這種控制,甚至在不利條件下繼續分裂。TP53基因可以在多個腫瘤類型里發生,不同腫瘤類型中TP53基因的突變頻率不同,最高的是子宮癌肉瘤,肺腺癌居然也達到了60%多。
p.R65Qfs*84Exon4是4號外顯子上有一個移碼突變,目前未在相關的癌症資料庫中查到該突變是不是有害信息,你可以發一下染色體的位置,然後再判斷一下。

4. geo怎麼分析一個癌基因在正常組織和癌組織中的mrna表達

原癌基因和抑癌基因在正常細胞中表達。解析:原癌基因:主要負責調節細胞周期,控制細胞生長和分裂的進程。抑癌基因:主要是阻止細胞不正常的增殖。

5. 如何直接查找tcga數據中某一基因在某一腫瘤中的表達

一個良好的開端就是分析感興趣基因的突變和其它異常,ICGC數據門戶提供了幾條研究路線。輸入一個基因名稱,NCBI登錄號,或者Ensembl基因ID,點擊基因報告(Gene Report),就能在突變摘要(Mutation Summary)中找到已發現的突變和拷貝數變化,以及迄今為止,這些突變在腫瘤中出現的頻率。COSMICsection就在體細胞突變列表下方,包括了點突變,少量缺失,以及插入突變等方面的數據。

另外一種方法就是在一種腫瘤中尋找所有受到影響的基因,在ICGC數據門戶中,研究人員能通過點擊數據搜索(Database Search)下的Genes,然後選擇感興趣的腫瘤類型,以及一些其它參數,比如分析的途徑等,這樣就能找到所有受到影響的基因。除此之外,TCGA數據門戶中,還可以從Download Data menu上選擇批量下載(Bulk Download),獲取體細胞突變數據,以及其它類型數據,比如拷貝數,DNA甲基化,基因表達。

6. 如何確定一個基因是癌基因和抑癌基因說明理由

原癌基因和抑癌基因都存在於正常的細胞中,癌基因可以通過病毒感染,非病毒因子誘發等多種途徑被激活,然後誘導觸發一系列與細胞生長分化有關的基因表達,從而至病,抑癌基因的丟失,突變,失活,也會導致細胞的癌變。
兩組細胞群一起通過進行試驗,一組為已經癌變的細胞,另一組為未發生癌變的細胞。然後分別導入該段基因。同樣條件培養,一段時間後,分別觀察兩組細胞群是否癌變,如果癌變組細胞死亡,非癌變組無明顯反應,則證明該基因為抑癌基因;非癌變組細胞癌變,癌變組細胞不明顯反應,則證明該基因具有原癌特徵。

7. 做了一個癌症的基因檢測。結果說我有6個癌症基因是不是我很快就會得病而死

基因檢測的主要用途是用來優生的。
也就是家庭中有某種遺傳性的疾病,就需要做基因檢測,生育後代時,針對性的選擇不生育含致病基因的孩子,這樣來保證後代的健康。
現在市場化的,對沒有生育要求人一些病人,甚至是普通疾病也做什麼基因檢測,就純粹是看中你的錢了。
真正的基因檢測只有錯位、倒位、缺失、移位等術語。使用高風險、陰性、陽性這類用語的,只是假借了基因檢測這個名,不多說,你應當懂的。
如果從基因的角度看每一個人,世界上就沒有完美的人,人人都有基因方面的缺陷,甚至一個人攜帶多個致病基因,只表明這個人患某種疾病的概率比別人大,但並不會表現出病態。
建議你安心快樂的生活,就這把次所謂檢測的結果當做一個屁吧

8. 如何確定一個基因是癌基因和抑癌基因說明理由

原癌基因和抑癌基因都存在於正常的細胞中,癌基因可以通過病毒感染,非病毒因子誘發等多種途徑被激活,然後誘導觸發一系列與細胞生長分化有關的基因表達,從而至病,抑癌基因的丟失,突變,失活,也會導致細胞的癌變.
兩組細胞群一起通過進行試驗,一組為已經癌變的細胞,另一組為未發生癌變的細胞.然後分別導入該段基因.同樣條件培養,一段時間後,分別觀察兩組細胞群是否癌變,如果癌變組細胞死亡,非癌變組無明顯反應,則證明該基因為抑癌基因;非癌變組細胞癌變,癌變組細胞不明顯反應,則證明該基因具有原癌特徵.