❶ ncbi，embl和什麼並稱三大資料庫
DDBJ:DNA Data Base of Japan 是日本人建立的核酸資料庫；
NCBI中的Genbank是美國建立的核酸資料庫；
EMBL是歐洲建里的核酸資料庫；
這三個資料庫是連通的，數據共享。
❷ YLWWINNER是什麼
分子生物學資料庫的演變經歷了文獻索引資料庫、事實資料庫和知識資料庫三個階段。
生物信息學涉及的資料庫可大致分為二種：初級資料庫和二級資料庫。
一級資料庫（初級資料庫）：資料庫中的數據直接來源於實驗獲得的原始數據，只經過簡單的歸類整理和注釋。
二級資料庫：對原始生物分子數據進行整理、分類的結果，是在一級資料庫、實驗數據和理論分析的基礎上針對特定的應用目標而建立的。
國際上著名的初級核酸資料庫有Genbank資料庫、EMBL核酸庫和DDBJ庫等；蛋白質序列資料庫有SWISS-PROT、PIR等；蛋白質結構庫有PDB等；基因組資料庫等。
國際上二級生物學資料庫非常多，它們因針對不同的研究內容和需要而各具特色，如人類基因組圖譜庫GDB、轉錄因子和結合位點庫TRANSFAC、蛋白質結構家族分類庫SCOP等等。
EMBL資料庫的每個條目是一份純文本文件。每一行最前面是由兩個大寫字母組成的識別標志， 歐洲國家的許多資料庫如SWISS-PROT、ENZYME、TRANSFAC 都採用EMBL格式。
GenBank序列文件由單個的序列條目組成。序列條目是一個純文本文件，由欄位組成，每個欄位由關鍵字（為完整的英文字，不用縮寫）起始（每行左端或為空格），後面為該欄位的具體說明。有些欄位又分若干次子欄位，以次關鍵字或特性表說明符開始。每個序列條目以雙斜杠「//」作結束標記。
Genbank庫包含了所有已知的核酸序列和蛋白質序列，以及與它們相關的文獻著作和生物學注釋。
PubMed系統是由美國國立生物技術信息中心（NCBI）開發的用於檢索MEDLINE、PreMED-LINE資料庫的網上檢索系統。MEDLINE是美國國立醫學圖書館（U.S.National Library of Medicine）最重要的書目文摘資料庫，內容涉及醫學、護理學、牙科學、獸醫學、衛生保健和基礎醫學。
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)：是目前常用的資料庫搜索程序，意為「基本局部相似性比對搜索工具」。國際著名生物信息中心都提供基於網路的BLAST伺服器。
SWISS-PROT和PIR是國際上二個主要的蛋白質序列資料庫。
資料庫查詢(database query) ：對序列、結構以及各種二次資料庫中的注釋信息進行關鍵詞匹配查找。有時也稱資料庫檢索，它和互聯網上通過搜索引擎 (Search engine) 查找需要的信息是一個概念。
資料庫搜索(database search
是指通過特定的序列相似性比對演算法，找出核酸或蛋白質序列資料庫中與檢測序列具有一定程度相似性的序列。最為著名的信息檢索系統是美國NCBI開發的Entrez數據檢索系統和EBI開發的SRS序列檢索系統
資料庫相似性搜索工具最常見的是FASTA工具和BLAST工具。
EMBL的發送系統為WebIn
GenBank 的發送系統sequin
測序工作者可以把自己工作中獲得的新序列提交給NCBI，添加到Genbank資料庫。這個任務可以由基於Web界面的BankIt或獨立程序Sequin來完成。
確定DNA序列之間或蛋白質序列之間相似性程度的過程稱為序列比對(sequence alignment)。
雙序列比對(pairwise alignment)是指通過一定演算法對兩個DNA或蛋白質序列進行比較，找出兩者之間最大相似性匹配。
變異的種類主要有以下三種： 替代(substitution)插入或刪除(insertion or deletion) indel 重排(rearrangement
同源序列是從某一共同祖先經趨異進化而形成的不同序列 。
相似性（similarity）指序列比對過程中用來描述序列之間相同或相似DNA鹼基或氨基酸殘基序列所佔比例的高低。
同源性（homology）是指從一些數據中判斷出兩個基因在進化上曾具有共同祖先的結論。
全局比對(global alignment)：
從全長序列出發，考察兩個序列之間的整體相似性。
局部比對(local alignment)：
著眼於序列中的某些特殊片斷，比較這些片斷之間的相似性、
（3）K-元法/字法
(k-tuple method /word method)
該方法從尋找完全匹配的短片斷(稱為k-元或字)出發，並以此為基礎運用動態規劃方法將這一片斷向兩端延伸，得到較長的相似性匹配。
在進行序列兩兩比對時，有兩方面問題直接影響相似性分值：取代矩陣和空位罰分。
空位:序列中任意連續的盡可能長的空格
空位開放 (gap opening)
對新空位的產生進行的空位開放罰分（a）
空位延伸（gap extension )
對空位延伸所進行的空位延伸罰分（b）
空位罰分（Wk）的數學公式
Wk=a+bk k為連續空位個數
@空位處罰特點：1、同常對於a會選擇一個高分（10-15分）對於b會選擇一個低分（1-2分）
2、大的空位設置值配以很小的空位擴展罰值被普遍證實是最佳的設定思路
@目前最有名的蛋白質矩陣Blosum、PAM
@PAM矩陣要點：可觀測突變百分率
核酸序列的檢索
1.NCBI中的Entrez
*核酸中載體序列的識別和去除VecScreen
重復序列分析 有CENSOR（EMBL）和RepeatMasker
CpG島識別 CpGPlot/CpGReport
啟動子與轉錄因子結合位點的識別TRES、Neural Network Promoter Prediction、Dragon Promoter Finder、 promoterInspector、NNPP2.1、TSSG、promoter2.0、Mcpromoter 。
內含子－外顯子剪接位點的識別SpliceView、NetGene2和BDGP中Splice Site Prediction等。
編碼區統計特性分析GRAIL和GenMark
tRNA基因的識別tRNAscan-SE
其它綜合基因預測工具GENSCAN
限制性內切酶分析REBASE(從google英文界面進入)
在線限制性酶切資源NEBcutter V2.0 WebCutter
PCR引物設計Primer 3 Genefisher
① 引物應用核酸系列保守區內設計並具有特異性。
② 產物不能形成二級結構。
③ 引物長度一般在15~30bp鹼基之間，常用的是18~27bp，但不應大於38bp，兩引物長度差異不超過3bp。
④ G+C含量在40%~60%之間。
⑤ 退火溫度在42~57℃，但兩引物間的退火溫度的差不可大於5℃ 。
⑥ 引物自身不能有連續4個鹼基的互補。
⑦ 引物之間不能有連續4個鹼基的互補。
⑧ 引物5′端可以修飾（加酶切位點序列；標記生物素、熒光素、地高辛等 ）。
⑨ 引物3′端不可修飾。
⑩ 引物3′端要避開密碼子的第3位，一般避免使用鹼基A，最好為G和C。
PIR國際蛋白質序列資料庫(PSD)是由蛋白質信息資源(PIR)、慕尼黑蛋白質序列信息中心(MIPS)和日本國際蛋白質序列資料庫(JIPID)共同維護的國際上最大的公共蛋白質序列資料庫。這是一個全面的、經過注釋的、非冗餘的蛋白質序列資料庫，
PSD資料庫有幾個輔助資料庫，如基於超家族的非冗餘庫等。PIR提供三類序列搜索服務：基於文本的互動式檢索；標準的序列相似性搜索，包括BLAST、FASTA等；結合序列相似性、注釋信息和蛋白質家族信息的高級搜索，包括按注釋分類的相似性搜索、結構域搜索GeneFIND等。
SWISS-PROT是經過注釋的蛋白質序列資料庫，由歐洲生物信息學研究所(EBI)維護。資料庫由蛋白質序列條目構成，每個條目包含蛋白質序列、引用文獻信息、分類學信息、注釋等，注釋中包括蛋白質的功能、轉錄後修飾、特殊位點和區域、二級結構、四級結構、與其它序列的相似性、序列殘缺與疾病的關系、序列變異體和沖突等信息。
ProtParam工具這是用於計算蛋白質的各種物理化學性質的工具，包括蛋白質的相對分子質量、理論pI值、氨基酸組成、原子組成、消光系數、半衰期、不穩定系數以及總平均親水性等。
Compute pI/MW工具 是ExPASy工具包中的程序，計算蛋白質的等電點和分子量。對於鹼性蛋白質，計算出的等電點可能不準確。
AACompldent工具 根據氨基酸組成辨識蛋白質。
PeptideMass工具 是分析蛋白質在各種蛋白酶和化學試劑處理後的內切產物。
蛋白質二級結構預測
nnpredict工具 （不能用，二級結構預測改用GOR）
HNN工具- Hierarchical Neural Network method
ProtScale工具蛋白質的疏水性分析
Tmpred---跨膜結構分析
COILS---捲曲螺旋預測
SignalP ---信號肽預測工具
蛋白質三級結構預測
SWISS-Model工具 自動蛋白質同源模建伺服器，有三個工作模式：Automated Mode、 Alignment Mode和 Project Mode。程序先把提交的序列在ExPdb晶體圖像資料庫中搜索相似性足夠高的同源序列，建立最初的原子模型，再對這個模型進行優化產生預測的結構模型。
最為著名的三大核心資料庫：PDB 生物大分子結構資料庫；SWISS-PROT 蛋白質序列資料庫；
GENBANK 核酸資料庫
公認三大核酸資料庫：NCBI(美) EMBL（歐洲） DDBJ（日）
❸ 常用的資料庫有哪些
1. IBM 的DB2
作為關系資料庫領域的開拓者和領航人，IBM在1997年完成了System R系統的原型，1980年開始提供集成的資料庫伺服器—— System/38，隨後是sql/DSforVSE和VM，其初始版本與SystemR研究原型密切相關。DB2 forMVSV1 在1983年推出。該版本的目標是提供這一新方案所承諾的簡單性，數據不相關性和用戶生產率。1988年DB2 for MVS 提供了強大的在線事務處理（OLTP）支持，1989 年和1993 年分別以遠程工作單元和分布式工作單元實現了分布式資料庫支持。最近推出的DB2 Universal Database 6.1則是通用資料庫的典範，是第一個具備網上功能的多媒體關系資料庫管理系統，支持包括Linux在內的一系列平台。
2. Oracle
Oracle 前身叫SDL，由Larry Ellison 和另兩個編程人員在1977創辦，他們開發了自己的拳頭產品，在市場上大量銷售，1979 年，Oracle公司引入了第一個商用SQL 關系資料庫管理系統。Oracle公司是最早開發關系資料庫的廠商之一，其產品支持最廣泛的操作系統平台。目前Oracle關系資料庫產品的市場佔有率名列前茅。
3. Informix
Informix在1980年成立，目的是為Unix等開放操作系統提供專業的關系型資料庫產品。公司的名稱Informix便是取自Information 和Unix的結合。Informix第一個真正支持SQL語言的關系資料庫產品是Informix SE（StandardEngine）。InformixSE是在當時的微機Unix環境下主要的資料庫產品。它也是第一個被移植到Linux上的商業資料庫產品。
4. Sybase
Sybase公司成立於1984年，公司名稱「Sybase」取自「system」和 「database」 相結合的含義。Sybase公司的創始人之一Bob Epstein 是Ingres 大學版（與System/R同時期的關系資料庫模型產品）的主要設計人員。公司的第一個關系資料庫產品是1987年5月推出的SybaseSQLServer1.0。Sybase首先提出Client/Server 資料庫體系結構的思想，並率先在Sybase SQLServer 中實現。
5. SQL Server
1987 年，微軟和 IBM合作開發完成OS/2，IBM 在其銷售的OS/2 ExtendedEdition 系統中綁定了OS/2Database Manager，而微軟產品線中尚缺少資料庫產品。為此，微軟將目光投向Sybase，同Sybase 簽訂了合作協議，使用Sybase的技術開發基於OS/2平台的關系型資料庫。1989年，微軟發布了SQL Server 1.0 版。
6.PostgreSQL
PostgreSQL 是一種特性非常齊全的自由軟體的對象——關系性資料庫管理系統（ORDBMS），它的很多特性是當今許多商業資料庫的前身。PostgreSQL最早開始於BSD的Ingres項目。PostgreSQL 的特性覆蓋了SQL-2/SQL-92和SQL-3。首先，它包括了可以說是目前世界上最豐富的數據類型的支持；其次，目前PostgreSQL 是唯一支持事務、子查詢、多版本並行控制系統、數據完整性檢查等特性的唯一的一種自由軟體的資料庫管理系統.
7.mySQL
mySQL是一個小型關系型資料庫管理系統，開發者為瑞典MySQL AB公司。在2008年1月16號被Sun公司收購。目前MySQL被廣泛地應用在Internet上的中小型網站中。由於其體積小、速度快、總體擁有成本低，尤其是開放源碼這一特點，許多中小型網站為了降低網站總體擁有成本而選擇了MySQL作為網站資料庫。MySQL的官方網站的網址是： www.mysql.com
❹ 國外主要期刊資料庫有哪些
有科學引文索引、社會科學引文索引、科技會議錄索引、Engineering Village、EBSCO等。
1、科學引文索引
美國《科學引文索引》（Science Citation Index, 簡稱 SCI ）於1957 年由美國科學信息研究所（Institute for Scientific Information, 簡稱 ISI）在美國費城創辦，是由美國科學信息研究所（ISI）1961 年創辦出版的引文資料庫。
SCI從來源期刊數量劃分為SCI和SCI-E。SCI指來源刊為3500多種的SCI印刷版和SCI光碟版（SCI Compact Disc Edition, 簡稱SCI CDE），SCI-E（SCI Expanded）是SCI的擴展庫，收錄了5600多種來源期刊，可通過國際聯機或網際網路進行檢索。
SCI涵蓋學科超過100個，主要涉及農業、生物及環境科學；工程技術及應用科學；醫學與生命科學；物理及化學；行為科學。
2、社會科學引文索引
社會科學引文索引為SCI的姊妹篇，亦由美國科學信息研究所創建，是可以用來對不同國家和地區的社會科學論文的數量進行統計分析的大型檢索工具。
1999年SSCI全文收錄1809種世界最重要的社會科學期刊，內容覆蓋包括人類學、法律、經濟、歷史、地理、心理學等55個領域。
收錄文獻類型包括：研究論文，書評，專題討論，社論，人物自傳，書信等。選擇收錄 (Selectively Covered)期刊為1300多種。
社會科學引文索引（Social Sciences Citation Index，簡稱SSCI）收錄報道並標引了2684種（截止到2009年6月9日）社會科學期刊，同時也收錄SCIE所收錄的期刊當中涉及社會科學研究的論文。
3、科技會議錄索引
《科技會議錄索引》（Index to Scientific & Technical Proceedings，簡稱ISTP）創刊於1978年，由美國科學情報研究所編輯出版。
該索引收錄生命科學、物理與化學科學、農業、生物和環境科學、工程技術和應用科學等學科的會議文獻，包括一般性會議、座談會、研究會、討論會、發表會等。其中工程技術與應用科學類文獻約佔35%，其他涉及學科基本與SCI相同。
4、Engineering Village
Engineering Village是最權威的工程、應用科學領域文獻檢索平台。Engineering Village平台上的10多個資料庫涵蓋了工程、應用科學相關的最為廣泛的領域，內容來源包括學術文獻、商業出版物、發明專利、會議論文和技術報告等等；
其中的Compendex 就是美國工程索引Engineering Index資料庫，是全世界最早的工程文摘來源。 現如今，Compendex 是科學和技術工程研究方面最為全面的文摘資料庫，涉足190個工程學科，囊括了從1969年至今的1130多萬份文摘記錄。
5、EBSCO
EBSCO Publishing （縮寫EP）是EBSCO Instries,Inc.的一個業務部，全面負責文獻信息相關產品和服務。最早的業務是期刊代訂服務。
正是憑借為美國軍方機構提供期刊代訂服務，Stephens夫婦創立的這家公司得以發展壯大。公司在圖情業界俗稱EBSCO，也是基於此。
在23個國家設有辦公室，服務於全球200個國家和地區的客戶。主要服務對象是研究型大學、科學院所、政府部門、大型醫療機構以及公司等。
參考資料來源：網路——科學引文索引
參考資料來源：網路——社會科學引文索引
參考資料來源：網路——ISTP
參考資料來源：網路——Engineering Village
參考資料來源：網路——EBSCO
❺ 基因資料庫 一般使用什麼資料庫
集合所有已知核酸的核苷酸序列，單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述，包括它們的科學命名、來源物種分類名稱、參考文獻等信息的資料庫。基因和基因組的資料也包含在DNA資料庫中。目前國際上比較重要的核酸（含蛋白質）一級資料庫有美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個資料庫信息共享，每日交換，故資料是一樣的，唯格式有所不同。
❻ 如何介紹lexisnexis資料庫
LexisNexis是世界著名的資料庫，全球許多著名法學院、法律事務所、高科技公司的法務部門都在使用該資料庫。該資料庫連結至40億個文件、11,439個資料庫以及36,000個來源，資料每日更新。
法律研究內容：美國聯邦與州政府的案例（收錄約300年之全文案例）；美最高法院案例（1790年至今）；美最高法院上訴案例；美地方法院及州法院的案例及判決書；所有聯邦律法及規則；50州法規；法律評論（論文來自450多種評論雜志）。
歐洲聯邦律法；專利資料庫（收錄1980年以來的歐、美、日之專利全文）、英聯邦國家法律法規和案例、WTO之相關案例和條文、其它律法主題等。
新聞報紙、雜志、學術期刊：LexisNexis新聞服務的資料來自世界各地九千多個數據源。資料種類包括主要的報紙，國際性的雜志、學術期刊等服務。學術期刊包括全套的ABI Inform全文資料。
公司檔案，世界范圍內9,100萬家上市及非上市公司的詳細檔案，內容涵蓋公司簡介、年度財務數據、董事會及高管名單、股票圖表、信用評級、關聯公司目錄、所涉訴訟和新聞、知識產權信息。
全部信息來自：
《標准普爾公司報告》（Standard &Poor』s Corporate Descriptions)、《胡佛公司報告》（Hoovers Company Reports)、《公司披露報告》（Disclosure Reports)、《跨國公司報告》（International Company Reports)等權威報告。
❼ 歐洲的本土搜索引擎有哪些
Google
Yahoo
Lycos
MSN
T-Onlinev
Web
Altavista
Fireball
Wanadoo
Nomade
AOL
Club-internet
Virgilio
arianna.iol
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Dmoz分類目錄簡介：
ODP是人工編輯目錄索引類搜索引擎，它的編輯人員均為世界各地的志願者，目前其志願編輯人數已達數萬人。ODP除獨立提供搜索服務外，還為包括AOL
Search、
Netscape
Search、
Google、
Lycos、
DirectHit、
HotBot等在內的許多門戶網站和搜索引擎提供主要的目錄搜索服務。
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Overture搜索引擎簡介：
Overture是雅虎公司的子公司，互聯網上主要的商業搜索服務提供商，擁有十萬以上的廣告商客戶及合作夥伴，其中包括Yahoo!,
MSN和CNN，為他們提供一系列的網上產品搜索和相關服務搜索。
Overture總部位於加利福尼亞的Pasadena,在美國紐約、芝加哥、派羅阿托、加利福尼亞有辦事處，非美業務總部設在愛爾蘭，歐洲、亞洲、澳大利亞均設有辦事處。
Overture，即原來的GoTo.com於1997年九月由Bill
Gross』Idealab成立，1998年6月，公司開始了付費推廣搜索服務，使廣告商們通過對指定關鍵詞競價，得到不同的搜索結果排名。一年後，公司完成了其普通股的原始公共積累，開始在納斯達克股票市場上市。2003年10月7號，雅虎公司收購Overture,現在是雅虎子公司。
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Inktomi/msn搜索引擎簡介：
Inktomi公司是著名的互聯網搜索結果提供商，現在是雅虎子公司,也是OEM網路搜索與付費登錄服務主要提供商。Inktomi成立於1996年，核心搜索技術基於美國伯克利大學的一項搜索研究方案，這項方案利用的是平行計演算法。
今天，Inktomi通過一些頂級的門戶網站和目標站點向全世界半數以上的互聯網用戶提供最新、最相關的搜索結果。Inktomi
的付費登錄保證了十萬多零售商和內容發布者把最深入的網上內容在Inktomi
搜索索引資料庫中展示並及時更新。如付費登錄這樣的搜索引擎營銷方案，因其作為發展最快的發展方式而被廣泛採用
Inktomi網路搜索提供和付費登錄合作夥伴包括Amazon.com,
eBay,
HotBot,
MSN,
Overture、WalMart.com.等
❽ 全球排名前十商業版資料庫有哪些
IBM
老牌大數據企業，從微軟時代過來的核心，是全球最大的信息技術和業務解決方案公司。
2. 惠普
會最為知名的是它的Vertical分析平台，而且在2012年的營收中排名第二，當之無愧的老牌商業資料庫品牌。
3. Teradata
憑借自身硬體和資料庫而聲名遠播。
4. 甲骨文
在資料庫領域，甲骨文一直都是鼎鼎大名的存在，而且它也是大數據領域最大的幾個玩家之一。
5. SPA
在商業數據中，SPA推出了最為知名的HANA內存內資料庫
6. EMC
EMC 的主要業務時幫助客戶保存並分析大數據，另外也充當著大數據分析智囊營銷科學實驗室的所在地，它們專門分析營銷類數據。
7. Amazon
時至今日，Amazon 已經成為了全球大數據領域當之無愧的王者，這一切源於它的CEO貝索斯的遠見與無與倫比的魄力
8. 微軟
微軟在數據方面有著雄厚的實力和強大的野心，它的商業數據業務也在蓬勃發展
9. 谷歌
作為全球搜索業務的老大，谷歌旗下的大數據平台憑借其身後的技術積累，成為商業數據領域內一股不可小覷的力量。
10. VMware
VMware向來以雲計算虛擬化解決方案著稱
❾ 能進行專利檢索的資料庫有哪些
一、IncoPat專利資料庫
IncoPat科技創新情報平台是第一個將全球頂尖的發明智慧深度整合，並翻譯為中文，為中國的項目決策者、研發人員、知識產權管理人員提供科技創新情報的平台。無論您關心最新的技術發展，還是需要規避專利侵權風險，希望掌握競爭對手的研發動態，還是實現知識產權的商業價值，IncoPat都能為您提供及時、全面、准確的情報。
二、佰騰專利資料庫
專利檢索六種檢索方式，讓檢索更簡單、更方便。兩個資料庫選擇，一個平台，同時滿足中國、美國、日本、英國、法國、德國、瑞士、俄羅斯、PCT組織和歐洲專利局的所有檢索需求。另外，資料庫中設計了多種結果處理功能，十分人性化。如：對檢索結果的排序功能、對比查看功能、全文閱讀功能、專利類型選擇功能、法律狀態查看、圖片顯示模式、在線翻譯、打包下載、PDF合成下載功能等等。通過檢索，有效幫助用戶查看世界領先專利技術，了解國外公司就某項技術在中國的專利申請布局及其世界市場策略，為用戶自身的創新和發展提供思路、指引方向。
三、無量專利網資料庫
巨量的專利文獻，包括中國、歐洲、美國、日本、韓國等在內的專利文獻主要出版地，並以每月百萬份的數量遞增。
全世界海量、專業、稀缺的專利文獻譯文，包含中英、中日、日英、德英等各語種專利文獻翻譯譯文、雙語譯文文檔。
大量各國各語種重要產業，包含分析報告、檢索報告、預警報告、評估報告等在內的各種形式專利報告及譯文。
海量的專利譯文情報為企業專利戰略規劃、專利技術攻堅、專利權利申請、專利產品保護、專利危機應急提供強大的情報信息支撐。
拓展內容：專利檢索的內容：在各專利網路資料庫中，可以從申請(專利)號、專利名稱、摘要、申請日、公開(公告)日、公開(公告)號、分類號、申請(專利權)人、發明人、專利代理機構、代理人、主權項、優先權等欄位入口進行檢索，也可在高級檢索界面進行多欄位的邏輯組配檢索。
法律依據：《中華人民共和國專利法》第十二條
任何單位或者個人實施他人專利的，應當與專利權人訂立實施許可合同，向專利權人支付專利使用費。被許可人無權允許合同規定以外的任何單位或者個人實施該專利。