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染色體的信息在哪個資料庫可以查

發布時間: 2022-08-24 15:02:42

Ⅰ 已知一個基因如何查找在哪個染色體上

根據文獻中已知的基因ID如果你在文獻中看到你感興趣的基因,而且文中還提到了
基因在Genbank中的ID號,那就好辦了,直接打開http://www.ncbi.nlm.nih.gov ,在Search後的下拉框中選擇Nucleotide,把Genbank ID號輸入GO前面的文本框中,點「GO」,就可以找到了。(如GenBank accession number gi 16151096)」。
2. 根據已經獲得的基因的相關信息進行查找,打開http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在search後面的下拉框中選擇Gene,然後在中間的文本框中輸入基因名稱「VEGF」,點擊GO。搜索結果出來了,點擊箭頭所指的Limits, Limits的意思其實就是高級檢索,你可以在這里對檢索詞進行很多限制,這樣能大大精簡查詢結果。我們接著來,在Limits這個界面,先選擇查詢的限定范圍:先選Gene name(基因名稱);然後再選擇Limit by Taxonomy(生物分類限定)中的Homo sapiens(人類),然後再點擊「GO」。直接點擊基因名稱「VEGFA」就可以看到有關基因的信息了。需要指出的是,在Genbank中,基因有很多別名(Aliases),和Genbank中記錄的名稱有可能不一致。比如在這里,VEGFA是Genbank中記錄的基因名稱,而它還有很多別名,比如MGC70609, VEGF(這就是我們要找的基因名稱 ), VEGF-A, VPF;還有,在這里可以看到該基因在染色體上的位置... 再往下看,可以看到Genomic regions, transcripts, and procts,這里顯示了該基因在基因組中的位置,以及轉錄本的生成情況:就看見了目的基因的mRNA的鏈接(如NM_001025366.1)和蛋白質的鏈接(如NP_001020537.2 ) 這里得說兩句,有的基因也許只有一個編碼序列,但有的基因有很多的mRNA剪接體,但都是歸在一個基因名稱下面。比如,在VEGF基因下面有7個序列,分別是vascular endothelial growth factor A isoform a, isoform c, isoform d, isoform e, isoform f , isoform g, isoform b precursor ,就需要根據查閱的文獻以及在這些基因序列後面的解釋來確定了。如果我想找的基因是第一個序列即isoform a, 就可以點擊NM_001025366.1

Ⅱ ncbi下載基因位置信息

針對你的要求,覺得 http://www.genecards.org/ 比NCBI要好用些
要下載整套資料庫是不可能的,只能查尋。你到genecards或者NCBI上輸入所要查詢的基因名稱或者編號。位置了,序列了,功能了,還有目前可用的試劑都可以查到的.
不過genecards只有人的。NCBI上可以查到其他動物的。

譬如,你要查人的p21基因。那就到這里
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1026
你要求的「已知基因的位置(在哪個染色體,具體位置是什麼),大概功能等等「都有了

Ⅲ 自己如何查decipher資料庫

有以下多種查看方式:
1. Genome browser通過基因組瀏覽器來查看染色體特定位置,特定基因或者cytoband區域的變異分布情況。
2. Phenotype browser,可以查看各種表型對應的信息。
3. Genes,以基因為單位,展示了與疾病表型相關的基因組變異所在的基因。
4. CNV Syndromes,展示了與發育障礙綜合征相關的CNV變異。
5. Gene Disorders,clinvar資料庫中與表型相關的基因變異信息。

Ⅳ 有沒有可以直接查植物染色體數目的資料庫謝謝解答!

網頁鏈接

CCDB server - Chromosome Counts Database

Ⅳ 知道在染色體上的位置,如何查出那段基因序列

到NCBI網站,查人的基因組,找到關注的染色體就可以。

在染色體上獲取目的基因要用到限制性核酸內切酶,根據目的基因的基因序列來選擇相應的限制性核酸內切酶,限制性核酸內切酶就能切割出所需的目的基因了,並且根據切割的末端又可以分為粘性末端和平末端。

用於DNA基因組物理圖譜的組建;基因的定位和基因分離;DNA分子鹼基序列分析;比較相關的DNA分子和遺傳工程。

限制性核酸內切酶是由細菌產生的,其生理意義是提高自身的防禦能力。

限制酶一般不切割自身的DNA分子,只切割外源DNA。

(5)染色體的信息在哪個資料庫可以查擴展閱讀:

DNA分子類似「計算機磁碟」,擁有信息的保存、復制、改寫等功能。將人體細胞核中的23對染色體中的DNA分子連接起來拉直,其長度大約為0.7米,但若把它折疊起來,又可以縮小為直徑只有幾微米的小球。因此,DNA分子被視為超高密度、大容量的分子存儲器。

基因晶元經過改進,利用不同生物狀態表達不同的數字後還可用於製造生物計算機。基於基因晶元和基因演算法,未來的生物信息學領域,將有望出現能與當今的計算機業硬體巨頭――英特爾公司、軟體巨頭――微軟公司相匹敵的生物信息企業。

Ⅵ 如何在NCBI上下載基因在染色體上的信息

首先,基因名輸入到NCBI官網,將窗口調至gene選項,點擊進入;
其次找到該種屬的基因,點擊進入
然後點擊genebank,就能看到該基因的詳細信息以及在染色體上的信息。

Ⅶ 在pubmed上豬的Y染色體STR怎麼查

首先pubmed 資料庫沒有豬這種動物的str 但是利用所有資料庫的時候可以查到很多。你可以利用高級檢索(advanced search)查找。首先,在Search Builder上輸入chromosomes y然後點aad to
search box 按鈕;然後繼續在Search Builder上輸入str,再點上一步的按鈕;然後輸入pig 點那個按鈕。當然結果是0,那是因為你的資料庫選擇僅僅是pubmed,你在search的下拉窗口中選擇alldatabase,就會出現很多資料庫,開頭有數字的就是有相應數字的檢索結果;開頭為none的是沒有檢索結果。
這還沒完pig只是豬的一種稱謂,學術上也不會只用這種名詞,所以搜索時第三步的pig可以替代為hog,swine,Sus scrofa domestica Brisson,Sus ,Sus scrofa ,Sus domesticus等。pubmed不支持中文搜索,所以只能用英文搜。希望能夠幫到你。

Ⅷ 番茄資料庫如何找染色體長度

在UCSC的主頁上,點擊Genomics,然後點擊human圖標,獲取其他物種的染色體長度。
染色體(chromosome)是細胞在有絲分裂或減數分裂時DNA存在的特定形式。細胞核內,DNA緊密卷繞在稱為組蛋白的蛋白質周圍並被包裝成一個線狀結構。當細胞不分裂時,染色體在細胞核中是不可見的——在顯微鏡下也是如此。