❶ 中國有哪七大生物基因庫
佳學基因的基因庫有以下幾個部分組成。基因實體庫，用來貯存DNA樣本。基因功能庫，用來貯存具有特殊功能的DNA序列。罕見疾病DNA資料庫。基因序列變化資料庫。人類基因序列變化與人體表徵資料庫。
❷ 基因組資料庫的簡介
基因組資料庫是分子生物信息資料庫的重要組成部分。基因組資料庫內容豐富、名目繁多、格式不一，分布在世界各地的信息中心、測序中心、以及和醫學、生物學、農業等有關的研究機構和大學。基因組資料庫的主體是模式生物基因組資料庫，其中最主要的是由世界各國的人類基因組研究中心、測序中心構建的各種人類基因組資料庫。小鼠、河豚魚、擬南芥、水稻、線蟲、果蠅、酵母、大腸桿菌等各種模式生物基因組資料庫或基因組信息資源都可以在網上找到。隨著資源基因組計劃的普遍實施，幾十種動物、植物基因組資料庫也紛紛上網，如英國Roslin研究所的ArkDB包括了豬、牛、綿羊、山羊、馬等家畜以及鹿、狗、雞等基因組資料庫，美國、英國、日本等國的基因組中心的斑馬魚、羅非魚(Tilapia)、青鱂魚(Medaka)、鮭魚(Salmon)等魚類基因組資料庫。英國穀物網路組織(CropNet)建有玉米、大麥、高粱、菜豆農作物以及苜蓿(Alfalfa)、牧草(Forage)、玫瑰等基因組資料庫。除了模式生物基因組資料庫外，基因組信息資源還包括染色體、基因突變、遺傳疾病、分類學、比較基因組、基因調控和表達、放射雜交、基因圖譜等各種資料庫。
❸ 生物學資料庫都有哪些
分子生物學資料庫大全：核酸資料庫、基因表達資料庫、蛋白資料庫、糖資料庫、專利資料庫等國際頂尖資料庫列表可以在生物幫那裡找到的，我一般找資料，最新資訊都是到那裡的，他們比較專業，權威，也比較全面，技術文檔，視頻，產品都蠻豐富的。年來大量生物學實驗的數據積累，形成了當前數以百計的生物信息資料庫。它們各自按一定的目標收集和整理生物學實驗數據，並提供相關的數據查詢、數據處理的服務。
❹ 分析miRNA的資料庫都有哪些
1、starBase
一個高通量實驗數據CLIP-Seq（或稱為HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP）和mRNA降解組測序數據支持的microRNA靶標資料庫,包含了miRNA-mRNA，miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA，miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的調控關系。整合和構建多個流行的靶標預測軟體的交集和調控關系。最新版本發布時間：2013年11月。
2、miRbase
眾所周知的microRNA基因注釋資料庫。目前miRBase只提供了microRNA的靶標的預測軟體的鏈接（如：PicTar）。最新版本發布時間：2010年9月。
3、ChIPBase
整合CLIP-Seq和ChIP-Seq的數據探討microRNA的轉錄和轉錄後調控，構建轉錄因子->microRNA->靶標的調控網路。最新版本發布時間：2012年11月。
4、Tarbase
一個收集已被實驗驗證的microRNA靶標資料庫。最新版本發布時間：2009年1月。
5、miRecords
一個整合的microRNA靶標資料庫。整合多個靶標預測軟體的調控關系。最新版本發布時間：2010年11月。
6、targetScan
基於靶mRNA序列的進化保守等特徵搜尋動物的microRNA靶基因。是預測microRNA靶標假陽性率較低的軟體。而且是microRNA領域大牛Bartel實驗室開發的。最新版本發布時間：2009年4月。
7、PicTar
基於microRNA或microRNA靶標聯合作用等特徵開發的搜尋動物的microRNA靶基因。假陽性率也較低。是microRNA領域大牛Rajewsky實驗室開發的。最新版本發布時間：2007年3月。
8、PITA
基於靶位點的可接性和自由能預測microRNA的靶標。是著名的生物信息學家Segal實驗室開發的。最新版本發布時間：2008年8月。
9、RNA22
基於序列特徵預測microRNA的結合位點。是幾個流行的microRNA靶標預測軟體的其中一個。IBM公司的研究團隊開發的。最新版本發布時間：2007年。
10、miRanda和microRNA.org
是著名的MemorialSloan-Kettering 癌症研究中心的研究人員開發的軟體和資料庫。miRanda的最新版本又叫mirSVR。最新版本發布時間：2010年8月。
11、MicroCosm
EMBL-EBI的Enright 實驗室開發的microRNA靶標資料庫。最新版本發布時間：2010年8月。
12、miRTarBase
整合實驗證實的microRNA靶標的資料庫。最新版本發布時間：2010年10月。
13、miRGator v2.0
整合microRNA表達、靶標和疾病相關信息的資料庫。最新版本發布時間：2010年11月。
14、MiRNAMap
動物的microRNA基因及其靶標的資料庫。最新版本發布時間：2008年1月。
15、miRDB
動物microRNA靶標預測和功能注釋資料庫。最新版本發布時間：2010年8月。
16、RNAhybrid
一個基於miRNA-target配對自由能預測microRNA的靶標。最新版本發布時間：2011年6月。
17、miRGen
microRNA基因和microRNA靶標資料庫。最新版本發布時間：2007年1月。
❺ 求基因表達常用資料庫
IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003轉錄本。
ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID，OTTHUMT00000090763是另一個資料庫對同一轉錄本的編號（Havana transcript）。
http://asia.ensembl.org/Homo_sapiens/Transcript/Summary?db=core;g=ENSG00000067704;r=1:220267444-220321380;t=ENST00000490891
UCSC Microarray Expression Data 給出了基因mRNA在人類不同組織中的表達量
http://genome.ucsc.e/cgi-bin/hgGene?hgg_gene=uc001hmc.2&hgg_prot=B2RPG8&hgg_chrom=chr1&hgg_start=220267454&hgg_end=220321376&hgg_type=knownGene&db=hg19&hgsid=193781719
GEO資料庫給出了詳細的基因mRNA在不同組織中的表達數據，
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
基因的表達量不等於轉錄本的表達量，特定轉錄本IARS2-003的表達量需要自行實驗證明。
❻ 存儲基因數據,一般用什麼資料庫
基金數據可以使用mysql，sqlserver等關系型資料庫
這種資料庫存儲效率高， 增刪改查比較方便
❼ 基因組資料庫的介紹
基因組資料庫(GDB)為人類基因組計劃(HGP)保存和處理基因組圖譜數據。GDB的目標是構建關於人類基因組的網路全書，除了構建基因組圖譜之外，還開發了描述序列水平的基因組內容的方法，包括序列變異和其它對功能和表型的描述。
❽ SNP研究常用資料庫有哪些
SNP的研究在當前仍然可以用入火如荼形容，一方面 是各大資料庫可以方便檢索到幾乎任何一個基因的SNP分布及其頻率，另一方面SNP的功能研究有非常大的研究空間和前景，這應歸於許多SNP的流行病關聯 研究重復性差，因此只有在功能上對其闡述才能解決根本問題。當前SNP功能研究主要有以下幾方面：1、報告基因轉染技術：這一技術主要用於研究啟動子 SNP對於mRNA轉錄效率，是通過觀察轉錄結局來判斷SNP是否具有功能。2、EMSA技術：通過在體外合成含SNP位點的寡 核苷酸與轉錄因子特異性結合，觀察結合的強度和效率,但是該技術由於只人工合成較短長度的寡核苷酸，沒有考慮SNP周圍遺傳背景環境的影響,因此在重復性 和說服力上不強。3、ChiP技術：該技術通過超聲將染色體碎片化, 再將碎片化的核酸與轉錄因子的結合，最後通過PCR技術觀察判斷結合的效率和強度，該技術克服了EMSA的一些缺點,當前做的文獻較多。
❾ 基因資料庫有哪些
單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述。
集合所有已知核酸的核苷酸序列，單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述，包括它們的科學命名、來源物種分類名稱、參考文獻等信息的資料庫。
基因和基因組的資料也包含在DNA資料庫中。目前國際上比較重要的核酸（含蛋白質）一級資料庫有美國的GenBank、歐洲的EMBL和日本的DDBJ。三個資料庫信息共享，每日交換，故資料是一樣的，唯格式有所不同。